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新型G/11家族木聚糖酶的设计及生物学分析
  • ISSN号:1000-5013
  • 期刊名称:《华侨大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q811.4[生物学—生物工程] Q556[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]华侨大学工业生物技术重点实验室,福建泉州362021
  • 相关基金:基金项目:国家重点基础研究发展(973)计划项目(2007CB707804);国家高技术研究发展(863)计划项目(2006AA020103);国家自然科学基金资助项目(20676048)
中文摘要:

运用Bioedit软件,从已知耐热性能较好的G/11木聚糖酶蛋白序列出发,构建调和序列,获得新型木聚糖酶.首先运用InterProScan得出该序列为G/11家族,再运用MotifScan确定其活性部位,对比G/11木聚糖酶的特征序列确定该酶为木聚糖酶.通过SWISS-MODEL对其三级结构进行预测,了解信号肽长度为27个.运用Protparam Tool对其部分理化性质进行预测,得出其理论等电点为6.82,最适温度为81.72℃,高于调和前的任何一条序列.最后,通过选择宿主菌最优密码子获得其基因序列.

英文摘要:

A novel xylanase sequence was obtained by using 13ioedit to compare six G/11 thermostable xylanase protein sequences. The calculated optimal temperature of the new sequence was 81.72 ℃, which was higher than any of the six ancestral sequences. Firstly, we knew this new sequence belonged to G/11 through using InterProScan, and got its active site by using MotifScan. The signal peptide of the new xylanase could know by using the SWISS-MODEL which predicted the tertiary structure of the protein, The length of the signal peptide was 27. By using protparam tool, we got some physical and chemical properties of the new xylanase, from which we knew the theoretical isoelectric point of it was 6. 28. The gene encoding of the xylanase was generated through the optimal codon used by the host strain. The current study paved the way for the synthetic biology of xylanase.

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期刊信息
  • 《华侨大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:福建省教育厅
  • 主办单位:华侨大学
  • 主编:
  • 地址:中国福建泉州华侨大学校内杨思椿科学馆五楼
  • 邮编:362021
  • 邮箱:journal@hqu.edu.cn
  • 电话:0595-22692545
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5013
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1079/N
  • 邮发代号:34-41
  • 获奖情况:
  • 1995年11月,获教育部科技司颁发的“全国优秀高校...,1997年3月,获中宣部、国家教委、新闻出版署颁发...,1999年7月,获教育部颁发的“全国优秀高校自然科...,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5573