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非离子表面活性剂对鞘氨醇单胞菌MH13转化吩嗪的影响
  • ISSN号:0367-6358
  • 期刊名称:《化学世界》
  • 分类:Q39[生物学—遗传学]
  • 作者机构:上海交通大学生命科学技术学院 微生物代谢国家重点实验室,上海200240
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(2013CB966802);上海交通大学医工交叉研究基金“基于组学特征谱的新型遗传性疾病诊断工具”(YG2016NS33);上海交通大学科学工程计算教育部实验室和北京大学深圳研究生院化学基因组学省部共建实验室2016年开放基金;国家自然科学基金委本科理科基地项目(J1210047)
中文摘要:

小胖威利综合征和天使综合征是两种在15号染色体长臂(15q11-q13)发生基因变异的遗传性疾病。本研究对这两种细胞株的培养液开展基于高效液相色谱-质谱联用的代谢物组学数据收集,并利用XCMS在线分析平台对代谢产物组进行全局对比分析。通过Metlin数据库筛查代谢物组差异分析所命中的代谢产物,进一步依据Bio Cyc Pathway数据库绘制出包含这些显著差异代谢物结点的代谢网络通路。数据分析共发现了70种显著差异的代谢物和36个被高度覆盖的代谢通路,在此基础上探究了首次发现的、在代谢差异分析中最为显著的吗啡生物合成和尼古丁降解通路与疾病表型的潜在关联性,为遗传疾病的无损分子诊断提供了代谢组学基础和生物标志物候选靶标。

英文摘要:

Prader-Willi and Angelman syndromes are two genetic diseases caused by mutations on the long arm of chromosome 15(15q11-q13). We carried out LCMS data collection on the culture solutions of the two disease cell strains, and then studied their metabolomics differentiation with online XCMS tool. The global metabolomics analysis gave the 70 most significant metabolites using Metlin database, resulting in the 36 top related pathways based on Bio Cyc Pathway database. We analyzed the most significant pathways, including morphine biosynthesis and nicotine degradation pathways at the genetic and metabolic levels. These outcomes may provide fundamental understandings and biomarker candidates on the two diseases in a viewpoint of metabolomics.

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期刊信息
  • 《化学世界》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:上海华谊集团公司
  • 主办单位:上海市化学化工学会
  • 主编:高滋
  • 地址:上海市卢湾区南昌路203号
  • 邮编:200020
  • 邮箱:shahua@online.sh.cn
  • 电话:021-64733615
  • 国际标准刊号:ISSN:0367-6358
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1274/TQ
  • 邮发代号:4-19
  • 获奖情况:
  • 2004年度上海市科协系统优秀科技期刊奖,2002年第五届全国石油和化工行业优秀科技期刊二等奖,中国科技论文统计源期刊,1994-1998年度上海市科协系统第四届优秀科技期刊...,全国中文核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18873