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大豆SUMO化相关基因在热激条件下的表达分析
  • ISSN号:1007-9084
  • 期刊名称:《中国油料作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S565.103[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]东北农业大学农学院,黑龙江哈尔滨150030, [2]黑龙江省农垦科研育种中心,黑龙江哈尔滨150090, [3]65301部队副业基地,黑龙江五大连池164100, [4]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金(31471516,31271747); 黑龙江省高校长江后备支持计划项目(2014CJHB004)
中文摘要:

为探讨SUMO(类泛素的小蛋白修饰,small ubiquitin-like modifier)在大豆逆境胁迫中的作用,对大豆SUMO系统的相关基因和蛋白质结构进行分析,与其它植物SUMO化相关基因构建系统发育树,并将大豆合丰25热激处理后,选取SUMO系统中的6个基因(Gm SUMO2,Gm SUMO3,Gm SAE1b,Gm SCEb,Gm E3f,Gm ESD4d)进行实时定量分析。结果表明,大豆Gm SUMO,Gm SAE1,Gm SCE,Gm E3f与木本植物亲缘关系较近;热激处理不同时段,大豆6个SUMO相关基因均有明显变化,Gm SAE1b起激活作用最先启动,Gm SUMO2/3和Gm SCEb表达趋势一致,验证了Gm SCEb的结合作用。热激10min后,Gm SUMO2/SUMO3相对表达量达到最低,而Gm ESD4d在叶中相对表达量达到近40倍,说明Gm ESD4d在叶中起去SUMO化作用。热激30min,在根中Gm SUMO2相对表达量达到近27倍,Gm SCEb达到10倍,Gm E3f达到近40倍。说明Gm SUMO2、Gm SCEb、Gm E3f主要在根中起作用。

英文摘要:

SUMO is an ubiquitin like peptide that binds to the target protein after translation. The sumoylation in plant has demonstrated an important role for the process in growth and development,stress response such as heat shock,flowering control and pathogen defense. In this study,soybean SUMO related gene and protein structure were analyzed by bioinformatics tools. The phylogenetic tree showed that most of soybean SUMO related genes were closely related to woody plants,which indicated that soybean SUMO related genes(Gm SUMO,Gm SAE1,Gm SCE,Gm E3f) evolved from woody plant. Six genes in SUMO(Gm SUMO2,Gm SUMO3,Gm SAE1 b,Gm SCEb,Gm E3 f,and Gm ESD4d) were analyzed by real-time PCR. With 0 to 30 min heat shock treatments,the gene expression of6 soybean SUMO genes showed obvious change,Gm SAE1 b first starts. After 10 min,relative expression level of Gm SUMO2/3 reached the minimum. However,relative expression level of Gm ESD4 d raised nearly 40 fold in leaf,which might play a major role of desumoylation in leaf. Then,30 min after heat shock,relative expression level of Gm SUMO2 increased nearly 27 times,Gm SCEb 10 times,Gm E3 f nearly 40 times in root,which showed that GmSUMO2,Gm SCEb and Gm E3 f mainly functioned in the root.

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期刊信息
  • 《中国油料作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国农科院油料作物研究所
  • 主办单位:中国农业科学院油料作物研究所
  • 主编:廖伯寿
  • 地址:湖北省武汉市武昌徐东二路2号油料所内
  • 邮编:430062
  • 邮箱:ylxb@oilcrops.cn
  • 电话:027-86813823
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-9084
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1429/S
  • 邮发代号:38-13
  • 获奖情况:
  • 分别于2008年、2011年和2014年连续三届被评为中国...,是北京大学2004-2014年《中文核心期刊要目总览》...,2016年版《中国科技期刊引证报告(核心版)》公布...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11301