位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
基于野生大豆导入系的大豆粒长和粒宽的QTL分析
  • ISSN号:1000-9841
  • 期刊名称:《大豆科学》
  • 分类:S565.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]东北农业大学农学院,黑龙江哈尔滨150030, [2]黑龙江省农业科学院齐齐哈尔分院,黑龙江齐齐哈尔161041, [3]黑龙江省农垦科研育种中心,黑龙江哈尔滨150050, [4]中国农业科学院作物科学研究所,北京100000
  • 相关基金:国家自然科学基金(31271747,31471516);国家高技术发展计划“863计划”(2013AA102602);东北农业大学博士启动基金.
中文摘要:

从大豆品种天隆1号的叶片中克隆GmNup96基因的cDNA序列,对其编码的氨基酸序列、蛋白质理化性质、一级结构、二级结构、亚细胞定位等进行了生物信息学分析。结果表明:GmNup96基因编码1022个氨基酸,为具有一定亲水能力的酸性蛋白,不具有信号肽,相对分子量为116.1997kDa;二级结构预测结果显示,GmNup96序列存在α-螺旋(46.87%)、无规则卷曲(26.32%)、延伸链(17.03%)和β-转角(9.78%),并无其它二级结构;系统进化树分析表明,大豆GmNup96基因与野生大豆、芸豆、绿豆、红小豆之间的亲缘关系更近。

英文摘要:

The cDNA of GmNup96 gene in Tianlong 1 was cloned, and its bioinformatics character was analyzed. The results showed that the gene encoded a 116. 199 7 kDa protein with 1 022 amino acids , which was a hydrophilic protein without signal peptide, and the GmNup96 protein contained a conserved autoproteolytic peptidase domain in the N terminus. Through the secondary structure prediction, GmNup96 protein contained alpha-helix (46. 87% ), beta turn ( 9. 78% ), extended strand ( 17.03% ) and random coil (26. 32% ). Phylogenetic analysis of GmNup96 and its homologs with different plant species were conducted by the software MEGA 5.1. The results showed that GmNup96 from Glycine max were near with. Glycine soja, Phaseus vulgaris, Vigna radiata var. radinta and Vigna angularis in genetic relationship.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《大豆科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江农业科学院
  • 主办单位:黑龙江省农业科学院编辑出版中心
  • 主编:刘忠堂
  • 地址:哈尔滨市南岗区学府路368号
  • 邮编:150086
  • 邮箱:dadoukx@sina.com
  • 电话:0451-86668735
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-9841
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1227/S
  • 邮发代号:14-95
  • 获奖情况:
  • 1988年获黑龙江优秀期刊奖,1996年获黑龙江省科技情报二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:12334