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基于级联神经网络的蛋白质二级结构预测
  • ISSN号:1000-3428
  • 期刊名称:《计算机工程》
  • 时间:0
  • 分类:TP183[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学机械与电子工程学院,杨陵712100, [2]青岛农业大学信息科学与工程学院,青岛266109, [3]西北农林科技大学信息工程学院,杨陵712100, [4]威海职业学院机电工程系,威海264210
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30471138)
中文摘要:

为提高蛋自质二级结构预测的精度,提出一种由两层网络构成的级联神经网络模型。第l层网络采用具有差异度的5个子网构成的网络模型,对第2层网络的输入编码进行改进。对PDB Select25中的36条蛋白质共6122个残基进行测试,结果表明,该模型能有效预测蛋白质二级结构,其预测精度分别比SNN,DSC,PREDSATOR方法提高5.31%,1.21%和0.92%,平均预测精度提高到69.61%。

英文摘要:

In order to improve the prediction accuracy of protein secondary structure, a cascade neural networks composed of two-level network is presented. The first level is composed of five subnets with different structure, and the coding method of the second-level is studied and improved. The model is employed to predict 36 nonhomologous protein sequences with 6 122 residues in PDBSelect25. Results show that the proposed model can efficiently improve the prediction accuracy, increasing the prediction accuracy by 5.31%, 1.21% and 0.92% respectively compared with SNN, DSC and PREDSATOR method, improving the average prediction accuracy to 69.61%.

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期刊信息
  • 《计算机工程》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华东计算技术研究所 上海市计算机学会
  • 主编:游小明
  • 地址:上海市桂林路418号
  • 邮编:200233
  • 邮箱:ecice06@ecict.com.cn
  • 电话:021-64846769
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3428
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1289/TP
  • 邮发代号:4-310
  • 获奖情况:
  • 1999~2000、2001~2002年度信息产业部优秀期刊奖,2003-2004、2005-2006年度信息产业部电子精品科技...,2007-2008、2009-2010年度工业和信息产业部电子精...,012年度中国科技论文在线优秀期刊一等奖,2013年度中国科技论文在线优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:84139