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棉花咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因的克隆及特征分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐830091
  • 相关基金:国家自然科学基金(30660088); 国家“863”项目(2006AA10Z184); 新疆自治区高技术研究发展计划(200611101); 农业部转基因重大专项(2009ZX08005-011B)
中文摘要:

根据棉花纤维特异表达cDNA文库得到的咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶基因EST序列设计引物,采用RT-PCR技术从棉花中克隆了一个CCoAOMT基因,命名为GhCCoAOMT2。GhCCoAOMT2基因cDNA(GenBank登录号为FJ376606)具有一个747 bp的开放阅读框,5′非编码区为12 bp,3′非编码区为243 bp,编码248个氨基酸,预测分子量约为28.023 kD,等电点为5.39。GhCCoAOMT2基因组序列长度为1 442 bp,包含4个外显子和3个内含子。氨基酸同源分析发现,GhCCoAOMT2与来自毛白杨、烟草和苎麻的CCoAOMT同源性较高。半定量RT-PCR检测表明,GhCCoAOMT2基因在棉花各个组织中都有表达,其中茎部的表达量最高。原核表达分析表明,最佳诱导表达条件为0.2 mmol/LIPTG在37℃下诱导6 h。

英文摘要:

According to results of cotton fibre preferentially expressed cDNA library analysis,we designed primers from EST sequences.RT-PCR method was used to clone CCoAOMT gene.A gene coding for CCoAOMT,designated as GhCCoAOMT2(GenBank accession no.FJ376606) was isolated from cotton(Gossypium hirsutum L.).The length GhCCoAOMT2 cDNA is 1 002 bp,including a 12 bp 5′-UTR,an ORF of 747 bp,and a 243 bp 3′-UTR.This cDNA sequence encoded a polypepide of 248 amino acid residues with a predicted molecular mass of 28.023 kDa and a basic isoelectric point of 5.39.Furthermore,a length of 1 442 bp sequence from genomic DNA of GhCCoAOMT2 was also cloned by PCR.The genomic DNA of GhCCoAOMT2 contains four exons and three introns.The deduced amino acid sequence of GhCCoAOMT2 had a high homology with PtCCoAOMT,NtCCoAOMT-3,and BnCCoAOMT-1.Semi-quantitative RT-PCR analysis revealed that GhCCoAOMT2 could be expressed in different kinds of cotton tissues,and its mRNA accumulated most abundantly in stem.To investigate the function of the GhCCoAOMT2 gene,the full-length open reading frame was fused into a prokaryotic expression vector pET-28a.SDS-PAGE indicated that the most high expression quantity was induced by 0.2 mmol/L IPTG treatment for 6 h at 37℃.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104