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棉花GhCCR1基因结构及表达分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐830091, [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金(31060173);国家自然科学基金(30660088); 国家"863"项目(2006AA10Z184); 农业部转基因重大专项(2009ZX08005-011B); 新疆自治区高技术研究发展计划(200611101)
中文摘要:

根据棉花GhCCR1基因的cDNA序列设计引物,采用PCR技术从棉花中克隆了GhCCR1基因的DNA序列,并采用半定量RT-PCR方法分析了GhCCR1基因在不同发育阶段棉纤维中的表达情况.结果表明:GhCCR1编码区DNA序列长度为1 161 bp,包含4个外显子和3个内含子,内含子富含AT,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则.半定量RT-PCR检测表明,GhCCR1基因在不同发育阶段的棉纤维中均有表达,在开花后20 d的棉纤维中表达量最高,说明该基因可能参与调控棉纤维细胞的伸长和次生壁的增厚过程.

英文摘要:

Primers were designed according to the cDNA sequence of cotton GhCCR1.PCR method was used to clone GhCCR1 from cotton and the expression of GhCCR1 in fibers at different developmental stages was analyzed by semi-quantitative RT-PCR.A length of 1 161 bp from genomic DNA of GhCCR1 was cloned by PCR.The genomic DNA of GhCCR1 contains four exons and three introns.Analysis of these introns indicated that they were rich in AT.All exon/intron junctions of the gene contain the gt/ag consensus splicing site.Semi-quantitative RT-PCR analysis revealed that GhCCR1 was expressed during different fiber developmental stages,and reached to the peak of expression in 20 days post anthers(DPA) fiber cells,suggesting that GhCCR1 may be involved in regulating fiber elongation and secondary wall thickening.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104