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雨生红球藻中crtO基因存在3个5’上游侧翼序列
  • ISSN号:1000-9620
  • 期刊名称:《海洋通报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q949.212[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]山东理工大学生命科学学院,山东淄博255049, [2]中国水产科学院黄海水产研究所,山东青岛266071
  • 相关基金:The research were supported by the National Natural Science Foundation (40706050; 40706048), Natural Science Foundation of Shandong University of Technology (4040306017) and Start-up Foundation for Ph.D of Shandong University of Technology (4041-405017; 4041-405016), National Key Technology R&D program(11200602), Foundation of State Commonweal Institute (2060402/2).
中文摘要:

在本研究中,我们首次通过基因组上游第一次步移克隆到了雨生红球藻中crtO基因的3个不同大小的5’上游侧翼序列1.1kb,1.9kb和2.2kb。利用生物信息学方法分别预测并比较了这3个不同大小的5’上游侧翼序列,结果发现,三者具有与高等植物相类似的顺式作用元件,如脱落酸反应元件(ABRE)、干燥或低温反应元件(DRE/C-repeat)、几种光反应元件(G1-box,GAG-motif,l-boxand ATC—motif)、热激反应元件(HSE)、机械伤害反应元件(WUN-motif)、生长素反应元件(TGA-element)、茉莉酸甲酯反应元件(TGACG-element)和反式作用因子MYB蛋白的结合位点(MBSandMRE)等等,但是三者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中crtO基因调控方式的多样化。

英文摘要:

Three separate 5'-flanking regions (1.1 kb, 1.9 kb and 2.2 kb) of crtO were cloned through walking upstream. Results of sequence analysis show that three 5'-flanking regions of crtO might have some similar putative cis-acting elements such as ABA (abscisic acid)-responsive element (ABRE), C-repeat/dehydration responsive element (C-repeat/DRE), light-responsive element (G-box, GAG-motif, I-box and ATC-motif), wound-responsive element (WUN-motif), auxin-responsive element (TGA-element), MeJA-responsive element (TGACG-element) and MYB binding site (MBS), except for typical TATA box or CCAAT box. These findings might mean diversiform regulatory patterns of crtO being in astaxanthin biosynthesis of Haematococcus pluvialis.

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期刊信息
  • 《海洋通报:英文版》
  • 主管单位:国家海洋局
  • 主办单位:国家海洋信息中心
  • 主编:徐胜
  • 地址:天津河东区六纬路93号
  • 邮编:300171
  • 邮箱:msb@mail.nmdis.gov.cn
  • 电话:022-24011287
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-9620
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1271/N
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录
  • 被引量:60