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狗牙根EST-SSR反应体系优化及其遗传多样性初步分析
  • ISSN号:1007-8614
  • 期刊名称:新疆农业大学学报
  • 时间:2014.4
  • 页码:112-118
  • 分类:S688.4[农业科学—观赏园艺;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]新疆草地资源与生态自治区9点实验室新疆农业大学草业与环境科学学院,乌鲁木齐830052
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31160483);新疆维吾尔自治区高技术项目(20111112);新疆农业大学国家重点学科项目(XJCYB一2011-05);新疆维吾尔自治区重点实验室项目(XJDX0209-2013-02)
  • 相关项目:新疆狗牙根抗寒分子标记的开发及抗寒基因克隆研究
中文摘要:

利用 L16(4)5正交实验设计,对新疆狗牙根 EST-SSR反应体系进行优化;并将该体系初步应用于14份新疆典型区域的野生狗牙根材料,通过聚类分析研究供试材料的亲缘关系.结果表明,新疆狗牙根 EST-SSR反应最优体系为:20μL反应体系中含模板DNA 100 ng,引物0.5μmol/L,2μL 10×Buffer,MgCl21.5 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶0.5 U.运用该体系对14份新疆狗牙根材料进行PCR扩增,条带较清晰,可用于新疆狗牙根 EST-SSR标记的进一步研究.对14份狗牙根的多样性及其亲缘关系分析结果表明,狗牙根 Nei’s 基因多样性指数(H)变异范围为0.2077~0.3153,平均为0.2550;Shannon信息指数(I)在0.2540~0.4394.

英文摘要:

The best optimized system from Xinjiang Cynodon dactylon L.were as follows:There were template DNA 100 ng,0.5 μmol/L of each primer,2 μL of 10 × Buffer,MgCl2 1.5 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA polymerase 0.5 U in 20μL reaction system.The 14 portions of Xinjiang Cynodon dactylon L.were amplified by use of the system,the bands were clearer,which can be used in studying Xin-jiang Cynodondactylon L.EST-SSR marker.The diversity and phylogenetic relationships of 14 portions of Cynodon dactylon L.were analyzed.The results showed that the variance range of diversity indexes (H)of Cynodon dactylon L.Nei’s were as follows:0.2077-0.3153,the average was 0.2550,the information index (I)was 0.2540 to 0.4394.

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期刊信息
  • 《新疆农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:新疆农业大学
  • 主办单位:新疆农业大学
  • 主编:雒秋江
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  • 国际标准刊号:ISSN:1007-8614
  • 国内统一刊号:ISSN:65-1173/S
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  • 获奖情况:
  • 1996年在第二届全国农业期刊评比中荣获“优秀农业...,1997年荣获第二届全国优秀科技期刊评比“三等奖”,1999年在全国高等学校自然科学学报及教育部优秀科...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘
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