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大豆GmPLC2基因的序列分析及表达特性
  • ISSN号:1000-5684
  • 期刊名称:《吉林农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学] S565.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]吉林农业大学生命科学学院,长春130118, [2]东北师范大学附属中学,长春130021, [3]吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心,长春130118
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31201144,31271746,31101091); 教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20122223120003); 吉林省发改委项目(JF2012C002-04)
中文摘要:

提取大豆叶片总RNA,利用RT-PCR法克隆GmPLC2基因的全长序列;利用生物信息学软件分析GmPLC2的蛋白三维结构及氨基酸组成、构建系统发育树;同时,利用实时定量PCR方法分析在不同逆境胁迫下GmPLC2基因的表达模式。结果表明:从大豆中克隆得到的GmPLC2基因全长1779bp,编码592个氨基酸。GmPLC2基因与绿豆、红车轴草的PLC基因编码氨基酸相似性为84.29%和79.63%。荧光定量PCR分析发现,盐碱、盐、碱、干旱和ABA胁迫处理后大豆叶片中GmPLC2基因的表达量出现不同程度的升高,碱胁迫6h时GmPLC2基因的表达量为0h的4倍。

英文摘要:

Total RNA was extracted from soybean leaves and full-length sequence of GmPLC2 was cloned by RT-PCR method. By using bioinformatics softwares, three-dimensional structure and ami- no acid compositions of proteins were analyzed and a phylogenetic tree was built. Meanwhile, ex- pression patterns of GmPLC2 gene under various abiotic stresses were investigated by real-time quantitative PCR method. The results indicate that GmPLC2 gene has a full-length of 1 779 bp and it encodes 592 amino acids. Amino acids encoded by GmPLC2 gene has a genetic similarity of 84.29% and 79.63% respectively with PLCs from Vigna radiate and Trifolium pretens, qRT-PCR analysis shows that expression levels of GmPLC2 gene rise under salt-alkali, salt, alkali, drought and ABA treatments. Expression level of GmPLC2 gene under alkali stress increases nearly fourfold compared to the control. The study presented in this paper will lay a foundation for further studies on functions of GmPLC2.

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期刊信息
  • 《吉林农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:吉林省教育厅
  • 主办单位:吉林农业大学
  • 主编:秦贵信
  • 地址:吉林省长春市新城大街2888号
  • 邮编:130118
  • 邮箱:jlndxb@vjlav.edu.cn
  • 电话:0431-84532914
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5684
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1100/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,全国中文农业类核心期刊,中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16398