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麻疯树Jc-TCTP1基因的同源性分析及时空表达模式鉴定
  • ISSN号:1007-7626
  • 期刊名称:中国生物化学与分子生物学报
  • 时间:0
  • 页码:727-734
  • 语言:中文
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] Q949.753.5[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学院,成都610064
  • 相关基金:国际合作项目2004-2006年(No.2003DFB00005);国家自然科学基金面上项目2007-2009年(No.30670204)
  • 相关项目:麻疯树生物柴油燃油成分含量和组成的种源差异及调控机理的研究
作者: 陈放|
中文摘要:

从麻疯树胚乳cDNA文库中获得了翻译调节肿瘤蛋白(translationally controlled tumor protein,TCTP)cDNA序列,命名为Jc-Tctp1(GenBank登录号为EF091818).该序列全长1410bp,开放阅读框由507个碱基组成.Jc-Tctp1编码的推测蛋白产物含有168个氨基酸残基,该蛋白具有典型的TCTP蛋白特点:由3个α螺旋组成α螺旋核心、4个β片层结构构成β片层核心,及微管结合结构域(MTB)和钙结合结构域(CaB).其推测氨基酸序列与巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)、油棕(Elaeis guineensis)、大豆(Glycine max)、水稻(Oryza sativa,japonica cultivar-group)、黑杨(Populus trichocarpa)、番茄(Lycopersicon esculentum)、西加云杉(Picea sitchensis)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)以及玉米(Zeamay)的TCTP同源性依次为93%、90%、85%、84%、85%、84%、77%、80%和77%.经构建含Jc-TCTP1在内的植物TCTP蛋白分子进化树分析,发现单子叶植物并未按照其生物学分类的地位出现聚合.用半定量RT-PCR研究Jc-Tctp1基因的表达模式,结果显示,其表达在转录水平上具有一定的组织和时间特异性,茎、Ⅰ期胚乳、胚中最为丰富,而在Ⅱ期胚乳和花中表达最弱.

英文摘要:

The full-length eDNA encoding a translationally controlled tumor protein (TCTP) has been isolated from eDNA library of Jatropha curcas L, denoted as Jc-Tctpl with GenBank accession number EF091818. The Jc-Tctpl is 1 410 bp in length that contains a 507 bp open reading frame (ORF) encoding a putative protein of 168 amino acid residures. The predicted structure of Jc-TCTP1 appeared to be consist of an a-helical core and a β-sheet core, which are composed of 3 major a-helices and 4 major β-sheets, respectively. A homologous microtubule binding (MTB) domain as well as a calcium binding (CAB) domain can also be identified from the predictions. The Jc-TCTP1 amino acid sequence is highly homologous to other TCTPs, such as from Hevea brasiliensis ( 93 % ), Elaeis guineensis ( 90 % ), C, tycine max ( 85 % ), Oryza sativa ( 84 % ), Populus trichocarpa (85%), Lycopersicon esculentum (84%), Picea sitchensis (77%), Arabidopsis thaliana (80%) and Zea may (77%). The semi-quantitative RT-PCR results have shown that Jc-Tctpl expression was the highest in the stem, endosperm at Ⅰ stage and embryo of Jatropha curcas tissues, and the lowest in the endosperm at stage Ⅱ and flower, demonstrating a pattern of temporal and spatial specific expression. This might related to certain divergence in the phylogenic analysis of plant TCTP sequences where the selected monoeots were not forming a separate cluster.

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期刊信息
  • 《中国生物化学与分子生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物化学与分子生物学会 北京大学
  • 主编:周春燕
  • 地址:北京市学院路38号北京大学医学部
  • 邮编:100083
  • 邮箱:shxb@bjmu.edu.cn
  • 电话:010-82801416
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7626
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3870/Q
  • 邮发代号:82-312
  • 获奖情况:
  • 被美国《CA》列入世界引用频次最高的《千种表》
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9731