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胡萝卜软腐欧文氏菌分子检测技术的研究
  • ISSN号:1001-411X
  • 期刊名称:华南农业大学学报
  • 时间:0
  • 页码:22-26
  • 语言:中文
  • 分类:Q939[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]云南农业大学农业生物多样性应用国家工程中心,云南昆明650201, [2]云南农业大学农科教学实验中心,云南昆明650201
  • 相关基金:国家自然科学基金(30760139);云南省自然科学重点基金(2003C0006Z,2004C007Z);农业部农业行业科研专项经费(nyhyzx07-056)
  • 相关项目:抗生素溶杆菌13-1对魔芋细菌性软腐病的生防作用机制研究
作者: 姬广海|
中文摘要:

胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜亚种Erwinia carotovora subsp.carotovora(Ecc)是引起魔芋和马蹄莲软腐病的主要病原细菌.本研究根据细菌L-氨基酸渗透酶同源基因设计URP核苷酸序列特异性引物进行普通PCR、巢式PCR,同时采用细菌16S-23SrDNA间的ITS序列设计引物及TaqMan探针进行实时荧光PCR,对样品中存在的胡萝卜软腐欧文氏菌进行检测,并比较了3种检测方法的特异性和灵敏度.结果表明,应用实时荧光PCR方法检测样品,其中存在的胡萝卜软腐欧文氏菌的最低菌悬液浓度可达10cfu/mL;巢式PCR灵敏度也可检测到10cfu/mL;而用普通PCR最低可检测到10^3cfu/mL.用实时荧光PCR和巢式PCR方法检测病菌,其灵敏度都比常规PCR提高了100倍,且实时荧光PCR方法更快速、简便、安全、准确,不需PCR的后续处理.实时荧光PCR方法适用于种苗、种球等检测领域.

英文摘要:

Erwina carotovora subsp, carotovora ( Ecc ) is the main bacterial pathogen leading to bacterial soft rot of Konjac and Zantedesehia. The specific primer sets and TaqMan probe were designed based on the DNA sequence of URP and 16S-23S rDNA ITS. Conventional PCR, Nested-PCR and real-time fluo- rescent PCR were used for detection of Ecc from cell suspension of pure culture and extracts of infected Konjac plant tissues. The results showed that real-time fluorescent PCR and Nested-PCR could achieve higher specific and sensitive detection of Ecc,with threshold 10 cfu/mL compared with conventional PCR (threshold 103 cfu/mL). However, real-time fluorescent PCR was simple, fast, assure and more accurate. It was suggested that this method was adopted to rapid detection of Ecc for the seed and seedling industry.

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期刊信息
  • 《华南农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:华南农业大学
  • 主办单位:华南农业大学
  • 主编:陈晓阳
  • 地址:广州天河区五山路483号
  • 邮编:510642
  • 邮箱:journal@scau.edu.cn
  • 电话:020-85280069 38746672
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-411X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1110/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第三届优秀科学技术期刊奖(2000),全国高校优秀科技期刊一等奖(2004),第三届国家期刊奖百种重点期刊(2004),中国高校精品科技期刊(2006)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16179