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扁吻鱼和塔里木裂腹鱼线粒体COI基因片段的比较研究
  • ISSN号:1674-3075
  • 期刊名称:水生态学杂志
  • 时间:2011.1.1
  • 页码:45-50
  • 分类:Q343.1[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]新疆维吾尔自治区水产科学研究所,新疆乌鲁木齐830000
  • 相关基金:新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2009211A30); 国家自然科学基金(31060356)
  • 相关项目:新疆塔里木河水系裂腹鱼类资源现状研究
中文摘要:

对扁吻鱼(Aspiorhynchus laticeps)和塔里木裂腹鱼(Schizothoraxbiddulphi)细胞色素c氧化酶亚基(COI)基因片段进行扩增。通过序列测定得到624bp的基因片段,无碱基的插入和缺失,A、T、G、C碱基中G含量最低,A+T含量高于G+C含量,与其它鱼类COI基因片段研究结果相一致。2个种间共检测到38处核苷酸替换,其中35处碱基转换,3处碱基颠换,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是密码子第3位点上的同义替换。在编码的208个氨基酸中,仅发生2处氨基酸替代,替代率为0.96%。采用Kimura-2法计算种间平均遗传距离为0.06,以鲤作外群构建NJ系统树,扁吻鱼和塔里木裂腹鱼亲缘关系较近,而与新疆裸重唇鱼、斑重唇鱼亲缘关系较远。

英文摘要:

Mitochondrial cytochrome oxidase subunit I(COI)fragments of Aspiorhynchus laticeps and Schizothorax biddulphi were amplified.By sequencing,the sequence of 624 bp nucleotide was obtained,and no insertion/deletion was observed.Base G content was the lowest of all,and the content of A+T was higher than that of G+C,which was similar to the results in other fishes.38 nucleotide substitutions were checked between the two species which included 35 transitions and 3 transversions,and most of them were synonymous transitions at the third codon positions in the protein-coding genes.There were only two amino acid substitution in encoded 208 amino acids,and the substitution ratio was 0.96%.The average genetic distance by Kimura-2 method between A.laticeps and S.biddulphi was 0.06.Cyprinus cyprio was chosen as an out-group,and the NJ clustering tree indicated that A.laticeps and S.biddulphi had the closest relationship.

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期刊信息
  • 《水生态学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国水利部
  • 主办单位:水利部中国科学院 水工程生态研究所
  • 主编:常剑波
  • 地址:武汉市武昌雄楚大街578号
  • 邮编:430079
  • 邮箱:sstx@mail.ihe.ac.cn
  • 电话:027-82926630
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-3075
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1785/X
  • 邮发代号:38-76
  • 获奖情况:
  • 中国水产核心期刊,湖北省一级优秀期刊,水利部优秀期刊,自然科学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3619