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长江口邻近海域沉积物中好氧氨氧化细菌群落多样性
  • ISSN号:1007-6336
  • 期刊名称:海洋环境科学
  • 时间:2013.10.10
  • 页码:641-646
  • 分类:P736[天文地球—海洋地质;天文地球—海洋科学]
  • 作者机构:[1]中国海洋大学海洋环境与生态教育部重点实验室,山东青岛266100, [2]上海市气候中心,上海200030, [3]中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003, [4]中国海洋大学海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室,山东青岛266100
  • 相关基金:国家自然科学基金重大国际(地区)合作项目(40920164004);国家自然科学基金(41076085);海洋公益性行业科研专项(201205031-03),致谢:感谢东方红二号全体船员在整个航次中的大力支持和帮助.
  • 相关项目:长江口及邻近海域底边界层生物地球化学过程研究
中文摘要:

从长江口邻近海域沉积物中提取好氧氨氧化细菌(aerobic ammonium-oxidizing bacteria,AOB)的DNA,通过构建硝化作用氨单加氧酶基因文库并划分操作分类单元(OTU)的方法,揭示好氧氨氧化细菌群落结构多样性。结果显示,研究的两个站位(G6站和33站)分别获得417和428个amoA基因克隆,其序列皆属于变形杆菌的β-亚纲,但与此亚纲中已有明确分类信息菌株的amoA基因序列距离较远,相似度较低;利用DOTUR软件将相似度不小于97%的序列归为一个OTU,两站均得到11个OTUs,但离岸较近的G6站沉积物中B.AOB具有较高的多样性,而离岸较远的33站则多样性较低,且两个站位中的优势类群差异明显。

英文摘要:

The clone libraries of ammonium monooxygenase encoding gene (amoA) in the sediments from adjacent waters of Cbangjiang Estuary were constructed and grouped into the operational taxonomic units (OTUs) to determine the community diversity of aerobic ammonium-oxidizing bacteria (AOB). A total of 417 and 428 sequences were obtained from station G6 and 33 respectively. Pbylogenetic analysis with the aligned sequences showed that the amoA sequences from two stations were all in the β-subdivision of Proteobacteria,but there was a further phylogenetic distance between them and the ones from strains which have been classified clearly. 11 OTUs from two stations were grouped respectively based on a 3% amoA gene sequence distance cutoff with the DOTUR program. The results showed a higher diversity of β-AOB in the sediment of station G6 offshore closer than station 33 offshore further. The dominated β-AOB populations of the two stations were obviously different.

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期刊信息
  • 《海洋环境科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家海洋局
  • 主办单位:国家海洋局海洋环境保护研究所 国家海洋环境监测中心 中国海洋环境科学学会
  • 主编:关道明
  • 地址:大连市303信箱(沙河口区凌河街42号)
  • 邮编:116023
  • 邮箱:hyhjkx@vip.126.com
  • 电话:0411-84783126
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-6336
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1168/X
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 第二届全国优秀科技期刊三等奖,首届全国环境期刊评比一等奖,2001、2002年度大连市优秀期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13001