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肾透明细胞癌中VHL基因联合肿瘤基因DNA甲基化用于临床预后评估的研究
  • 项目名称:肾透明细胞癌中VHL基因联合肿瘤基因DNA甲基化用于临床预后评估的研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81171996
  • 申请代码:H1606
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:张诚
  • 依托单位:哈尔滨医科大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

肾透明细胞癌(CCRCC)是较常见的成人恶性肿瘤,晚期、转移或复发患者总体疗效并不满意。目前对于CCRCC根治性肾切除后转移和复发风险的情况,迫切需要精确的预后评价指标作为指导。本项目在研究发现VHL抑癌基因作为检测指标存在局限性的基础上,提出综合VEGF、E-cadherin和肿瘤抑制基因(TSGs)的DNA甲基化等多指标检测的新策略,期望对其预后判断最终提供理论及实验依据。通过研究CCRCC和瘤旁组织中VHL联合上述基因甲基化情况与CCRCC的预后指标关系,明确VHL基因表达缺失和甲基化时上述基因的甲基化特征及基因产物表达与CCRCC预后的潜在关系。了解VHL/缺氧诱导因子(HIF)通路上VEGF和E-cadherin的表达与DNA甲基化关系。这为明确肾肿瘤的发病机制,使预后分析更加精确高效,提供可靠灵敏全面的分子生物学指标,具有重要临床研究意义。

结论摘要:

肾透明细胞癌(CCRCC)是较常见的成人恶性肿瘤,晚期、转移或复发患者总体疗效并不满意。综合VEGF、E-cadherin和肿瘤抑制基因(TSGsp15, p16, BRCA1,Rb, E-cadherin)的DNA甲基化等多指标检测的新策略,明确多个基因的甲基化谱式对肾癌的预警作用。同时,选择了722个在多种肿瘤中频繁发生甲基化改变的肿瘤相关编码基因,采用DNA甲基化定量分析芯片分析了肾癌组织细胞中各基因的甲基化状态。应用22个微卫星位点标记物,比较了3p, 4q, 6q, 7q, 8p, 9p, 14q, 17p的LOH,发现3p(VHL,PBRM1, BAP1,SETD2)的LOH频发和 14q(HIF1A)的LOH在肾癌中发生率较高,,与C-RP及一些肾外表现可以作为肿瘤预后的另一个预警手段。针对P53的上游调控基因ASPP1、ASPP2、IASPP的蛋白在110例肾肿瘤及瘤旁组织有差异性表达,ASPP1的IHC结果具有显著的差异性。对ASPP1在肾癌细胞系 (NC65、Caki2、CCF-RC1、CCF-RC2、786-0、ACHN、Caki-1)的表达情况及相关的细胞功能及调控机制进行了研究,应用110例的临床标本的临床信息及预后数据进行了相关性分析。用MTT方法明确7株肾癌细胞系,对四种常用的化疗药物的IC50,应用化疗耐受和敏感的细胞系进行二代测序(RNAseq: mRNA, miRNA, lncRNA, DNA methylation, CNS,SNP),同一样本多水平测序,与TCGA肾癌报告芯片数据及预后数据进行分析比对。本研究探讨了肾透明细胞癌发生的分子机制,并从表观遗传学角度,通过选择有一定代表性的表观遗传修饰基因,分析其生物学意义,阐明在肾癌发生中的作用,为肿瘤预后监测及预警、肿瘤治疗提供一个新的切入点。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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