RNA病毒与人类健康密切相关。大量研究表明RNA病毒基因组及各基因转录体末端非编码区(UTR)中存在多种保守的结构元件,对于病毒的复制、翻译和亚基因组形成等重要生命过程具有调控作用。研究UTR中结构元件的有效识别方法是深入研究其调控机制的前提,同时也为开发核酸靶向抗病毒药物提供可靠的药物作用靶标。由于目前很多RNA高级结构预测算法缺乏生物学意义和实验数据支持,导致以此为基础的结构元件识别面临诸多问题。对于长程相互作用结构,现有算法无法识别。本项目拟将核酸杂交实验与结构元件搜索算法结合起来,基于随机寡核苷酸库建立RNA单链区标记技术,基于反义寡核苷酸芯片建立长程相互作用标记技术,将实验结果量化后作为启发信息约束或引导结构元件搜索算法,从而建立一种全新的、实验与算法相结合的非编码区RNA结构元件可靠识别方法。该方法的研究也将为建立一种通用、简单、实验与计算相结合的RNA结构预测新方法奠定基础。
英文主题词untranslated region;strcucture element;heuristic identifiction