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RNA病毒非编码区结构元件的启发式识别
  • 项目名称:RNA病毒非编码区结构元件的启发式识别
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30600120
  • 申请代码:C0505
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:伯晓晨
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国人民解放军军事医学科学院
  • 批准年度:2006
中文摘要:

RNA病毒与人类健康密切相关。大量研究表明RNA病毒基因组及各基因转录体末端非编码区(UTR)中存在多种保守的结构元件,对于病毒的复制、翻译和亚基因组形成等重要生命过程具有调控作用。研究UTR中结构元件的有效识别方法是深入研究其调控机制的前提,同时也为开发核酸靶向抗病毒药物提供可靠的药物作用靶标。由于目前很多RNA高级结构预测算法缺乏生物学意义和实验数据支持,导致以此为基础的结构元件识别面临诸多问题。对于长程相互作用结构,现有算法无法识别。本项目拟将核酸杂交实验与结构元件搜索算法结合起来,基于随机寡核苷酸库建立RNA单链区标记技术,基于反义寡核苷酸芯片建立长程相互作用标记技术,将实验结果量化后作为启发信息约束或引导结构元件搜索算法,从而建立一种全新的、实验与算法相结合的非编码区RNA结构元件可靠识别方法。该方法的研究也将为建立一种通用、简单、实验与计算相结合的RNA结构预测新方法奠定基础。

结论摘要:

英文主题词untranslated region;strcucture element;heuristic identifiction


成果综合统计
成果类型
数量
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  • 会议论文
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