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利用HITS-CLIP技术解析哺乳动物Argonaute蛋白的功能分工
  • 项目名称:利用HITS-CLIP技术解析哺乳动物Argonaute蛋白的功能分工
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31200593
  • 申请代码:C050202
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:徐辉
  • 依托单位:中山大学
  • 批准年度:2012
中文摘要:

Argonaute(AGO)蛋白是小RNA介导的基因沉默途径的核心效应分子。多细胞生物通常有多个AGO蛋白。在果蝇、线虫等低等生物中,多个AGO已演变出专门的职能参与不同的RNA沉默途径。相比之下,关于哺乳动物不同AGO蛋白在细胞中如何分工及其机制如何仍有待阐明。我们前期研究发现在胚胎发育的小鼠肝脏中,四个AGO(AGO1-4)的表达模式有很大差异,为我们解析体内AGO之间的分工提供了良好的研究模型。在此基础上,本项目拟采用HITS-CLIP技术 (紫外交联免疫沉淀获得RNA进行高通量测序),结合生物信息分析,在转录组水平系统研究小鼠胚肝细胞中不同AGO蛋白在小RNA分拣和靶标选择上的异同,解析肝脏发育过程中不同AGO蛋白-小RNA-靶标组成的基因调控网络的动态变化,阐明四种AGO蛋白的特异性职能及其独特的表达模式对于肝脏发育的重要意义。

结论摘要:

英文主题词Argonaute;CLIP;miR-122;targetome;HCV


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