中文摘要：

收集香蕉栽培品种和我国野生种种质资源。分别以尖叶蕉种（Musa. acuminata Colla，AA基因组）和长梗蕉种（Musa. bilbisiana Colla，BB基因组）为实验材料构建基因组文库，依次进行抑制性PCR、5'锚定PCR和选择性扩增微卫星PCR, 回收克隆PCR产物并测序, 设计SSR标记特异引物，以及根据搜索已公开的香蕉基因组数据中的重复序列，设计SSR标记特异引物，再PCR扩增筛选鉴定出我国种质资源AA和BB基因组型特异的SSR分子标记。分别对国内外香蕉栽培品种和我国不同野生种进行SSR 基因型分子鉴定。在分子水平上评估我国香蕉栽培品种的遗传多样性、野生种群体间和群体内的遗传多样性，分析我国香蕉栽培品种的历史演化和亲缘关系；构建我国香蕉栽培品种SSR分子标记的指纹图谱，解决生产上栽培品种同物异名、同名异物问题。本项研究为重要性状的分子标记和分子育种奠定基础。

结论摘要：

香蕉是我国重要的热带水果，其种质资源，特别是野生种质资源的收集和系统分类研究比较薄弱，受栽培品种杂交很难结实的影响育种进展也是缓慢，缺乏生产需要的优质抗病新品种。本项目收集我国香蕉栽培品种247份、野生种8个，15个野生蕉居群和发现2个新的野生材料。对野生种的形态学特征进行了观测、图片拍照和SSR分析，为我国香蕉的系统分类和进一步研究香蕉的起源与进化奠定了基础。在我国首次开发香蕉EST-SSR分子标记43个，AA基因组SSR分子标记55个和BB基因组SSR分子标记54个，并从2960个棉花SSR分子标记转移筛选268个可作为香蕉的SSR分子标记加以应用。应用筛选的39个SSR 分子标记对60个栽培品种进行了遗传多样性分析和指纹图谱的构建，发现多个与目前大面积栽培品种遗传差异突出的优异种质可作为香蕉育种材料利用，构建的指纹图谱可应用于品种的知识产权保护和种苗的快速检测。应用筛选的15个SSR分子标记对15个野生蕉居群的遗传多样性进行了分析，为制定野生香蕉的保护策略提供了依据。本研究发现全世界大面积栽培的基因组型为AAA的品种遗传背景基本相同，应用SSR分子标记很难区分它们之间的遗传差异