针对新疆阿尔金山地区的阿牙克库木湖、阿其克库勒湖和鲸鱼湖三大高海拔盐湖,不同季节不同区域采样,分析样品的物理性质与化学成分;采用可培养与非培养相结合的方法,通过对16S rRNA基因和 rpoB'基因及其氨基酸序列的系统发育分析,系统地调查阿尔金山地区高海拔盐湖嗜盐古菌资源和多样性,研究三个盐湖不同季节不同位点嗜盐古菌群落分布的特点和规律,分析嗜盐古菌群落结构变化与环境因子的关系,进而探讨高海拔盐湖嗜盐古菌群落结构形成和演化机制;测定3-5个有代表性嗜盐古菌全基因组精细图,对其进行详细注释、比较基因组及分子进化分析,从而探讨嗜盐古菌对高海拔高盐环境的适应性,以及物种形成和演化机制。本项目对探讨高海拔盐湖嗜盐古菌的物种多样性与环境适应和系统演化都具有十分重要的意义。
salt lake;archaea;high-thorughput sequencing;meta-genomics;evolution
从新疆阿尔金山盐湖获得的水样,通过我室多种不同优化后的培养基培养,获得多株古菌的纯培养物。同时,我室通过高通量测序进行古菌基因组的研究,为进一步研究保守基因和功能基因提供了基础。获得的部分古菌新种以基于16SrRNA为分子演化标记,进行多相分类学鉴定。对于分类学上有异议的,通过二代测序获得全基因组数据,通过全基因组学的角度来权衡其分类地位。我室拟进一步通过宏基因组等方法研究该环境内的古菌物种多样性,从而为演化研究提供丰富的数据基础。