高温菌乙醇发酵是纤维素乙醇生产的有效途径,因此嗜热厌氧乙醇杆菌成为研究热点。最近的研究发现,嗜热厌氧乙醇杆菌的乙醇代谢关键酶的基因表达受还原力感应蛋白(Tet-RSP)的调控。本项目将研究Tet-RSP与DNA的相互作用,分析结合位点的碱基序列和DNA结构特征;研究以辅酶NAD(P)+和NAD(P)H构成的还原力或微环境的氧化还原状态对Tet-RSP与各结合位点的结合力的影响;利用嗜热厌氧乙醇杆菌的RNA聚合酶的核心酶和Sigma因子建立体外转录检测系统,用以模拟相关基因的转录水平和转录调控机制;通过体外转录检测Tet-RSP对adhE 和adhB的转录调控作用,分析还原力水平与乙醇代谢关键酶基因转录水平之间的关系,阐明还原力对高温菌乙醇代谢的调控作用及分子机制,为提高乙醇产量的代谢途径工程获得理论依据。本项目是在乙醇代谢研究的最新进展的基础上开展工作,具有研究特色和创新性。
Thermoanaerobacter ethanolicus;regulation;RSP;in vitro transcription;metabolic engineering
嗜热厌氧杆菌具有代谢速度快、水解纤维素能力强、戊糖转化率高等特点。但是目前嗜热厌氧杆菌发酵生产乙醇的浓度还很低,要提高嗜热厌氧杆菌乙醇的产量,首先要解析其乙醇代谢网络,找到其中与乙醇代谢密切相关的酶,及其调控蛋白,才能对其进行代谢工程,从而提高乙醇产量。因此本课题要实现的主要目标是阐明还原力感应蛋白RSP介导嗜热厌氧杆菌糖酵解和乙醇代谢的分子机制,为嗜热厌氧杆菌的代谢工程提供靶点。(1)在嗜热厌氧杆菌中发现了能对乙醇代谢关键酶基因进行调控的蛋白PadhE-1和PadhE-2 (RSP)。通过比对发现调控蛋白PadhE-1与全局调控因子CcpA具有同源性,而RSP具有NAD(P)-binding结构域,与还原力感应蛋白具有同源性。(2)通过凝胶阻滞实验,发现1 mmol/L的NADH能完全抑制RSP与醇脱氢酶基因adhB的启动子区域 (TRRadhB) 和醛/醇脱氢酶基因adhE的启动子区域 (TRRadhE) 的结合,而1 mmol/L的NAD+,NADP+,NADPH对RSP的DNA结合活性没有明显的影响;圆二色谱的检测结果表明,NADH能使RSP的?-螺旋减少和β-折叠片增加。(3)成功构建了嗜热厌氧杆菌体外转录系统,通过体外转录实验证实RSP能抑制基因adhB的转录,而NADH能解除RSP对adhB转录的抑制,NAD+虽然不能解除RSP对adhB转录的抑制,但NAD+能干扰NADH的作用。还原力感应蛋白RSP是迄今首次发现的糖酵解途径与发酵途径之间的调控枢纽。(4)确定了RSP与adhB和adhE上游启动子区域的结合位点,得到了完全互补的回文序列-ATTGTTANNNNNNTAACAAT-;对回文序列进行了定点突变,分析了其碱基偏好性。研究发现序列与回文结构越接近,其与RSP的结合力越强。这些结果说明,嗜热厌氧杆菌能通过操纵序列碱基差异而对乙醇代谢进行精密调控。(5)通过对嗜热厌氧杆菌进行代谢工程,发现导入adhE基因能增加乙醇产量。对adhE启动子的重新设计,解除RSP对adhE基因的转录抑制并不能进一步提高乙醇的产量。分析其中的原因,发现当环境中的乙醇达到一定浓度的时候 (乙醇浓度1 %),AdhB的催化特性发生逆转主要表现为催化逆反应,即消耗乙醇。因此进一步提高乙醇产量需要对AdhB进行定向进化,消除逆反应。