减数分裂重组是真核细胞减数分裂时同源染色体之间遗传物质的交换,它是真核细胞的减数分裂过程中必不可少的染色体行为,是有性生殖生物进化的重要推动力。本项目以酵母、果蝇和人基因组为研究对象,从回文序列与重组之间的关系着手,揭示回文序列在基因组层面上对重组发生频率的影响,探索在重组相关的进化压力下回文序列在染色体上的分布及其进化规律;挖掘重组与核小体定位之间的关联信息,从DNA序列与染色质结构相结合的角度阐明重组发生的位置偏好性;发展高维数据的降维方法和机器学习算法相结合的新的预测方法,建立基于DNA序列和染色质结构特征的重组频率预测模型,对基因组重组冷热点进行预测,刻画重组频率沿染色体的精细分布图谱。本研究对认识重组发生的分子机制及其生物学功能具有重要意义。
Recombination hotspot;Palindrome;Nucleosome positioning;Genome information quantity;
减数分裂重组是真核细胞的基本分子生物学过程,是减数分裂过程中必不可少的染色体行为,是有性生殖生物进化的重要推动力。因此,认识重组发生的分子机制和生物学功能具有重要的科学意义。经过三年的工作,项目组围绕减数分裂重组的位置偏好性机理这一科学问题开展了回文序列与重组的关系、核小体定位理论预测、核小体定位对重组的调控、重组冷热点的预测等几方面的工作。发表SCI检索论文8篇,核心期刊论文4篇,一般论文1篇,EI检索会议论文1篇,其它会议论文2篇,与核小体和假基因相关的内容又发表于学术专著《表观遗传学前沿》(清华大学出版社,2012年)。申报内蒙古自治区自然科学奖1项(题目相互作用网络及染色质结构水平遗传信息组织、传递规律的生物信息学研究),培养硕士研究生2名。