目前A型流感病毒血凝素蛋白已进化出16种亚型,各亚型毒株分离时间比亚型类群之间的进化分歧时间晚,从而导致毒株序列信息缺失,至今未见进化分歧点抗原性转变分子机制研究的相关报道。本项目拟采用最大似然法、多序列比对等分析方法,对处在进化分歧点的各亚型祖先蛋白序列进行推断,分析祖先序列与各亚型序列的差异,探索进化分歧点抗原性转变相关的氨基酸位点;在此基础上,采用探针拼接的方法合成祖先蛋白及其变异蛋白基因序列,利用杆状病毒表达系统表达并纯化,通过血凝抑制试验筛选抗原性转变相关的氨基酸位点;进而构建概率模型,获得进化分歧点抗原性转变相关的分子模式。本项目预期结果可用于建立进化分歧过程中抗原性转变的预测方法,提高A型流感病毒抗原变化的预测、疫苗设计的能力,对于早期防控疫病大流行具有非常重要的意义。
Influenza virus;Hemagglutinin;Evolution divergence;Antigen shift;
目前A 型流感病毒血凝素蛋白已进化出16 种亚型,至今未见进化分歧点抗原性转变分子机制研究的相关报道。本项目采用最大似然法、多序列比对等分析方法,对处在进化分歧点的各亚型祖先蛋白序列进行推断,分析祖先序列与各亚型序列的差异,找到一批进化分歧点抗原性转变相关的氨基酸位点;在此基础上,采用探针拼接的方法合成祖先蛋白及其变异蛋白基因序列,利用杆状病毒表达系统表达并纯化,通过血凝抑制试验筛选得到抗原性转变相关的氨基酸位点;进而构建概率模型,获得进化分歧点抗原性转变相关的分子模式。本项目达到预期研究目标,结果可用于建立进化分歧过程中抗原性转变的预测方法,提高A型流感病毒抗原变化的预测的能力。