中文摘要：

水牛是一种适应湿热气候环境，具有许多珍贵生物学特性的动物遗传资源。近年来随着我国南方农业产业发展和特色奶水牛业的兴起，水牛品种资源研究和开发都受到极大关注。本项目拟在已有研究基础之上，与澳大利亚昆士兰大学和孟加拉农业大学合作，通过微卫星数据整合，实现中国与东南亚水牛联合分析，揭示沼泽型水牛群体遗传结构和系统分类；然后利用线粒体DNA和Y染色体遗传标记，分析不同地理类群的线粒体和Y染色体单倍型系统发育关系；进而综合三类标记的研究结果，从基因组水平、母系遗传和父系遗传三个角度，全面分析中国及东南亚水牛的遗传变异性、群体遗传分化和群体间遗传关系等分子种质特征，探讨沼泽型水牛地起源、驯化和群体迁移历史，为沼泽型水牛的遗传分类、中国水牛资源的有效保护和科学利用提供客观依据。

结论摘要：

本项目通过与澳大利亚、荷兰、孟加拉、越南、老挝等五个国家科研机构合作，实现中国与东南亚水牛联合分析，系统研究了中国及东南亚水牛的起源分化和群体遗传关系。研究结果发现，泰国水牛及中国西南地区水牛遗传多样性最高，支持沼泽型水牛驯化中心在东南亚大陆北部及中国西南地区。菲律宾及马来西亚的水牛群体与中国东南群体遗传关系近，而泰国、印尼的群体与中国西南水牛群体关系较近。中国水牛整体遗传特性一致，只有云南德宏水牛是一个特殊类群，与东南亚泰国水牛遗传关系较近。利用线粒体Dloop和细胞色素b基因序列，全面分析了不同地理类群的线粒体单倍型系统发育关系；在中国德宏水牛内发现了一个新的沼泽型线粒体类型，确定槟榔江水牛是一个遗传混合群体。项目还开发了Y染色体多态性标记以及能够雌雄鉴别的方法。项目研究成果为揭示中国及东南亚水牛的起源、驯化和群体迁移历史，群体遗传分化和群体间遗传关系等分子种质特征提供了分子资料，为沼泽型水牛的遗传分类、中国水牛资源的有效保护和科学利用提供客观依据。