在系统分析高校学科建设与发展相关因素即高校学科建设与发展系统要素构成的基础上与充分考虑高教系统外部环境的作用,通过对国内高校科学研究与学科建设协调发展障碍的客观分析,系统地探讨科学研究与学科建设协调发展的模式、运行机制及结构体系,进而提出建立我国高校科学研究与学科建设协调发展的体制、政策及评估体系;运用系统分析方法,把高校科学研究与学科建设视为高校系统内的两个相互制约、相互促进、联系紧密的系统,同时构成了一个高校科学研究与学科建设协同的发展系统,进行了该系统的要素相关性分析、阶层性分析和整体性分析,以此对系统结构进行了研究:运用灰色系统理论和协同学方法,对高校科学研究与学科建设协同发展系统进行了灰色关联分析,构建了高校科学研究与学科建设协同发展系统模型,寻找该系统的序参量,并提出了系统优化建议全面研究分析了高校学科建设与科学研究协同系统管理模式,并在哈尔滨市部分高校中进行了实证研究;建立了测算高校R&D综合实力的二次相对评价方法和科研管理有效性的定量测评方法。