RNA干扰是真核生物中一个非常广泛而且保守的基因调节机制。早期的试验已经成功地表明小RNA 可以用来抑制癌基因和病毒基因的表达。然而,在小RNA被用于临床和制药之前,我们必须正确地了解小RNA的产生机理,作用机制和体内功能等。模式生物秀丽线虫中NRDE通路转运siRNA从细胞质到细胞核并抑制转录的延伸,从而缄默基因表达。然而,NRDE蛋白和siRNA如何抑制RNA聚合酶II以及如何造成组蛋白的甲基化尚不清楚。本项目将围绕以上问题,进一步研究模式生物秀丽线虫中siRNA 调控基因表达的作用方式,通过遗传筛选的办法来寻找调控核RNA干扰的关键因子以及研究它们作用的分子机理。这项研究有助于我们更深入地了解RNA干扰造成生长和生殖缺陷的原因和机理。从而不仅对理解RNA的基础生物学有重要意义,而且有助于更好地将小RNA干扰技术用于研究和临床治疗。
RNA interference;small regulatory RNA;nuclear RNAi defective pathway;epigenetics;histone methylation
项目背景 RNA干扰是一个非常广泛而且保守的基因调节机制。小调节性RNA广泛存在于几乎所有的真核细胞中,参与和调节许多基本的生命过程。RNA干扰技术的发现是近十年来生命科学研究的重大突破之一,不仅在加深人类生命过程的认识有巨大的影响,而且使我们在干预生命过程方面有了一个非常方便的手段。然而,在小RNA被用于临床和制药之前,我们必须更深入地了解小 RNA 的产生机理,运输途径,作用专一性,和体内功能等。 主要研究内容本课题重点研究了模式生物秀丽线虫中小干扰 RNA调控基因表达的作用机制,通过遗传、分子、细胞和生化等手段来寻找和研究调控细胞核RNA干扰的关键因子。分离了新的核RNA干扰的突变体;克隆了突变体基因;获得了突变体基因在亚细胞结构上的定位;分析了这些基因是否可以在非编码RNA的诱导下和前RNA以及染色质结合;研究了核RNA干扰在生长和生殖上的生理功能。 重要结果 在本课题的支持下,我们得到了以下几项结果 建立了秀丽线虫中研究非编码RNA干扰的错靶现象的模型,发现RNA干扰造成的错靶过程依赖于RdRP和核RNA干扰通路;发现小RNA可以诱导靶基因的组蛋白3赖氨酸27的3甲基化。 建立了秀丽线虫中使用CRISPR/Cas9技术进行大片段基因敲除的方法;建立了使用CRISPR/Cas9技术诱导染色体易位和构造平衡子的方法。 同时,我们还与合作实验室解析了非编码RNA介导基因干扰的遗传通路,发现了NRDE-1;发现秀丽线虫中非编码小干扰RNA诱导靶标位点及其附近区域的组蛋白3赖氨酸9的3甲基化。 在项目的支持下,以本实验室为独立单位发表SCI研究论文4篇(Current Biology, 2015; Genetics, 2014, 2015; Scientific Reports, 2014),应邀撰写综述3篇。与其它实验室合作发表研究论文2篇(PLoS Genetics, 2011; Nature Genetics, 2012)。毕业硕士1名。 科学意义 RNA干扰是真核生物中一个非常广泛而且保守的基因调节机制。本项目进一步研究了模式生物秀丽线虫中siRNA 调控基因表达的作用方式,寻找调控核RNA干扰的关键因子以及研究它们作用的分子机理。这项研究不仅对理解RNA的基础生物学有重要意义,而且有助于更好地将小RNA干扰技术用于研究和临床治疗。