基因的可变剪接增加了基因产物的多样性,相对于植物,高等动物的基因发生可变剪接的频率非常高,因此在研究动物基因的功能和表达时有必要考虑可变剪接因素。基因芯片技术已广泛应用于基因功能及表达的研究中,如果引入可变剪接因素,可使基因芯片研究的结果更加准确和完整。本项目将通过对74万家猪EST序列的分析,预测具有可变剪接形式的家猪基因,从中选择部分基因,针对每个不同的剪接形式设计特异性探针,用于基因芯片研究
基因的可变剪接增加了基因产物的多样性,相对于植物,哺乳动物的基因发生可变剪接的频率非常高,因此在研究动物基因的功能和表达时有必要考虑可变剪接因素。基因芯片技术已广泛应用于基因功能及表达的研究中,如果引入可变剪接因素,可使基因芯片研究的结果更加准确和完整。本项目通过对712,905家猪EST序列的分析,得到16,540个基因,其中1,223个基因可能具有平均2.8种不同的剪接形式。从中选择22个基因,针对54个不同的外显子共设计了54个长度50bp的特异性探针,制作了基因芯片。通过与家猪肝脏和肾脏组织的杂交试验,发现其中7个基因的不同外显子的杂交信号有显著差异。本项目验证了考虑可变剪接后,由基因芯片技术得到的基因表达谱结果可能有较大变化,从而为改进基因芯片技术提供了新的思路和理论、实践方面的依据。