乙型肝炎病毒(HBV)在体内存在的状态并不是我们以前想象的那样,各个病毒株之间的序列是均质的,实际上是很难找到2个完全一样的病毒,这种差别很小,是一种准种状态。利用基因克隆测序技术只能对有限的病毒基因进行分析,因此研究准种的技术必须改革,必须应用高通量的技术进行研究,基因芯片技术是一个合适的选择。HBV基因序列不同部位的突变和多态性,不同位点突变具有联合生物学效应,对于多个位点的检测,对于大批量患者的研究,必须采用诸如基因芯片等高通量的分析技术。应用基因芯片技术,将有助于阐明病毒存在的基本状态,有助于阐明HBV准种特点与临床的关系,以及抗病毒治疗之间的相互关系。是我们对于HBV的认识,从单一病毒水平提升到病毒群的水平,从静态的角度,提升到动态改变的角度,具有重要意义。
目前乙型肝炎的抗病毒治疗效果并不令人满意,其中HBV准种特点对于疗效的影响越来越受到人们的重视。近年来,基因芯片技术的应用,使多个病毒、多个基因位点、多个患者的大批量标本的高通量分析成为可能。本研究首先将以往的工作基础(500株HBV病毒株的基因序列、5株HBV全基因的序列)与临床资料结合,参考在GenBank中注册登录的200余株HBV全基因序列,设计并合成基因芯片的特异性探针500条。经过点样、水合、干燥、UV交联、洗涤、晾干等多步骤,制备500点的基因芯片。选择不同血清学标志的慢性乙型肝炎患者,包括HBeAg阴性和HBeAg阳性的慢性乙型肝炎患者。将基因芯片和探针杂交、扫描后,用ImaGene3.0软件分析荧光信号的强度。选择拉米夫定抗病毒治疗前后血清标本,进行基因芯片检测,并分析HBV准种特点与临床抗病毒疗效之间的关系。结果显示HBeAg阴性的慢性乙型肝炎患者体内HBV前C区基因序列准种突变。由于这些位点变异,部分解释了一些患者抗病毒疗效较差、预后较差的临床现象。结果提示抗病毒治疗效果与病毒准种有一定关联,应用基因芯片检测准种具有一定的实际应用价值。