产甘油假丝酵母WL2002-5是一株能在高渗条件下迅速生长、高效合成甘油、具有自主知识产权的工业生产菌株。为目前世界合成甘油效率最高的菌株之一。3-磷酸甘油脱氢酶(GPDH)是微生物细胞中由前体磷酸二羟丙酮合成甘油的关键酶,在酵母细胞的高渗透压适应和调节中起着重要作用。前期研究表明,高渗透压因子(如浓度为25%的葡萄糖和5%的NaCl溶液等)可显著诱导CgGPDH酶活力增加,大幅提高甘油积累量。为更好地理解CgGPDH受高渗透压诱导的分子机理,本研究在已成功克隆该新酶编码基因(FEMS Yeast Research ,2008, 30(4):508-14)并初步获得蛋白单晶的基础上,进一步测定并解析CgGPDH单体蛋白及该酶与底物、辅酶NADH和高渗透压因子等相互作用的蛋白质复合物三维结构,为阐明高渗条件下产甘油假丝酵母GPDH高效合成甘油的催化机理提供理论依据。相关研究未见报道。
yeast;glycerol 3-phosphate dehydroge;glycerol synthesis;structure characterization;catalysis mechanism
3-磷酸甘油脱氢酶(GPDH)是微生物酵母细胞中由前体磷酸二羟丙酮合成甘油的关键酶,在酵母细胞的高渗透压适应和调节中起着重要作用。前期研究表明,高渗透压因子(如浓度为25%的葡萄糖和5%的NaCl溶液等)可显著诱导GPDH酶活力增加,大幅提高酵母甘油积累量。为更好地理解GPDH受高渗透压诱导的分子机理,本研究在已成功克隆该酶编码基因的基础上,将3-磷酸甘油脱氢酶编码基因GPDH在大肠杆菌进行了高效表达和纯化,纯化后比酶活达到152.6mU/mg。并对酶学性质进行了初步研究,结果表明以DHAP为底物GPDH的Km值为0.55mmol/L,Vmax为1.06umol/(mL/min)。利用亲和层析、离子交换和分子筛纯化条件的摸索,确定了GPDH蛋白质的纯化方案,得到纯度达到95%以上的蛋白;利用晶体生长试剂盒对蛋白质GPDH结晶条件进行了筛选;获得了能够进行X-射线衍射研究的晶体;进一步测定并尝试解析了GPDH三维结构,结果表明GPDH结构主要由N-端NAD结合结构域和C-端底物DHAP结合结构域组成,酶活性口袋位于这两个结构域之间的沟槽中。N-端结构域主要由平行β折叠片和反向平行β折叠片组成的疏水内核,折叠片之间由α-螺旋连接,辅酶NAD结合在β折叠片内核的边缘。C-端结构域主要α-螺旋组成。上述结果为理解酵母GPDH合成甘油的催化机理提供了一定的理论依据。 研究过程中发表研究论文22 篇, SCI 论文9 篇,其中IF>3的SCI论文2篇;参编科学出版社的《2012年中国工业生物技术发展战略报告》1个章节的编写;申请国家发明专利8项,授权国家发明专利3项;合作培养博士研究生4名,硕士研究生8名;研究组成员发表国际学术会议论文5篇,报告5人次,发表国内学术会议论文30篇。