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基于基因调控的miRNA靶标预测算法研究
  • 项目名称:基于基因调控的miRNA靶标预测算法研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:61201408
  • 申请代码:F010805
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:刘辉
  • 依托单位:中国矿业大学
  • 批准年度:2012
中文摘要:

miRNA通过对靶标基因表达的调控,在癌症等疾病和生命过程中发挥重要作用。miRNA靶标的预测是miRNA研究的瓶颈和热点问题。针对miRNA靶标预测算法过度依赖序列信息而且性能不高的现状,本项目从基因调控角度入手,提出"miRNA→作用通路→转录因子→调控基因集"因果假设模型,并利用系统生物学思想开展靶基因预测算法的研究。本项目拟采用统计分析、机器学习、贝叶斯推断、基因富集度分析等方法,有机地融合序列信息、多种生物学实验数据、作用通路、转录因子调控信息以及其它生物学先验知识,在获得更高预测准确度的同时,对预测结果做出合理生物学解释,为后续的鉴定工作提供有力参考。本项目将为miRNA靶标预测提供新的思路,对阐明miRNA作用机制、揭示miRNA功能有重要意义。

结论摘要:

英文主题词miRNA;target prediction;regulatory network;lncRNA;RNA Methylation


成果综合统计
成果类型
数量
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