miRNA通过对靶标基因表达的调控,在癌症等疾病和生命过程中发挥重要作用。miRNA靶标的预测是miRNA研究的瓶颈和热点问题。针对miRNA靶标预测算法过度依赖序列信息而且性能不高的现状,本项目从基因调控角度入手,提出"miRNA→作用通路→转录因子→调控基因集"因果假设模型,并利用系统生物学思想开展靶基因预测算法的研究。本项目拟采用统计分析、机器学习、贝叶斯推断、基因富集度分析等方法,有机地融合序列信息、多种生物学实验数据、作用通路、转录因子调控信息以及其它生物学先验知识,在获得更高预测准确度的同时,对预测结果做出合理生物学解释,为后续的鉴定工作提供有力参考。本项目将为miRNA靶标预测提供新的思路,对阐明miRNA作用机制、揭示miRNA功能有重要意义。
英文主题词miRNA;target prediction;regulatory network;lncRNA;RNA Methylation