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基于Ribo-minus深度转录组测序的miR-21在癌细胞中作用机制研究
  • 项目名称:基于Ribo-minus深度转录组测序的miR-21在癌细胞中作用机制研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31200978
  • 申请代码:C060604
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:马利娜
  • 依托单位:中国科学院北京基因组研究所
  • 批准年度:2012
中文摘要:

已知miR-21调控大量重要肿瘤相关基因与多种癌症发生相关。由于胞内miRNA与靶基因的动态变化很难用软件预测,因此其他miRNA、靶mRNA以及内源竞争性非编码RNA(ceRNA)等都会直接或间接与miR-21对细胞癌变调控相关。为深入研究miR-21在癌细胞中作用机制,我们计划以正常和抑制miR-21表达的乳腺癌MCF-7细胞系为模型,运用Ribo-minus深度测序方法对mRNA、miRNA及长非编码RNA(lncRNA)的表达进行系统分析,组建相互作用网络,解析miR-21调控下转录组整体变化。筛选一批影响miR-21作用的关键基因和其它因子,并在已构建的乳腺癌从永生到癌变细胞模型中检测它们与miR-21的相关性,继而取乳腺癌样本及相应癌旁组织进行临床意义分析。此研究将使我们深入了解癌细胞中非编码RNA功能及不同类非编码RNA间的相互作用机制。

结论摘要:

英文主题词miR-21;microRNA;lncRNA;breast cancer;RNA-seq


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