基于近期阐明的HIV基因表达调控的分子生物学机制,选择了HIV Tat 蛋白与TAR RNA的结合激活病毒转录的关键环节,以HIV TAR RNA三碱基突起部位为靶,借助计算机模拟,设计并合成不同的系列的、能够与TAR RNA识别结合的小分子,用CD、DNA Tm(RNA Tm)、毛细管电泳及基因定点突变等方法研究系列小分子对病毒RNA结构的识别及其阻断病毒复制的分子机制。并依据病毒基因表达调控机制,构建含有目的基因的质粒,创立通过共转染,在基因转录表达水平上的抑制病毒复制的评价工作平台;同时,建立猴免疫缺陷病毒(SIV)感染淋巴细胞的模型,从形态学、细胞内信号转导途径及凋亡相关基因表达的改变,探讨病毒感染细胞后细胞内分子生物学改变的机制,特别是外源性小分子对基因表达及凋亡进程的干扰,从分子、基因、细胞水平多层次上综合深入探讨病毒基因转录调控的机制与外源性小分子阻断病毒复制的分子。
本项目基于近期阐明的HIV基因表达调控的分子生物学机制,选择了HIV Tat 蛋白与TAR RNA的结合激活病毒转录的关键环节,以HIV-1 TAR RNA三碱基突起的碱基序列及三维空间结构为靶点,以能特异识别突起的碱基的结构单元- - 精氨酸或胍基类似物与特定的配体连接,通过计算机分子模拟,设计了不同系列的小分子化合物,研究了它们对核酸的识别、对HIV Tat-TAR结合的抑制,从分子、基因、细胞等不同层次对新化合物进行了活性评价,总结了构效关系规律,产生了有应用前景的抗HIV活性新化合物。建立了通过质粒共转染从转录和基因表达水平进行抗HIV药物筛选的新的检测方法及用毛细管电泳技术从分子水平研究靶点特异性的方法。