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柑桔黄龙病的常规PCR及荧光定量PCR检测
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S436.661.1[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]重庆大学生物工程学院 基因工程研究中心,重庆400030, [2]柳州市鹧鸪江园艺场,柳州545002
  • 相关基金:教育部“春辉计划”项目(2003-589-18)资助,科技部创新基金项目(03C26215101121)资助
中文摘要:

[目的]为柑桔黄龙病的早期诊断和寄主体内病原菌的动态监测提供一种稳定、可靠的检验检疫技术。[方法]利用亚洲韧皮杆菌核糖体蛋白基因ro1J/ro1L设计了2对PCR引物CQULA03F/CQULA03R、CQULA04F/CQULA04R和1条TaqMan探针CQULAP1,以此为基础建立了常规PCR和TaqMan探针法、SYBRGreen Ⅰ荧光染料法两种荧光定量PCR(共3种)反应体系;确定了3种体系各自的检测灵敏度、特异性和准确性,据此对3种体系进行了比较;从2004年7月到2005年5月还利用常规PCR和TaqMan探针荧光定量PCR体系完成了对柑桔黄龙病病原菌在寄主体内的周年变化的动态监测。[结果]两种荧光定量PCR方法的灵敏度比常规PCR高出至少2~3个数量级,而TaqMan探针法由于使用了杂交探针,其特异性尤其可靠,另外两种定量PCR较小的产物片段使得它们具有更好的稳定性,加上荧光定量PCR方法本身受污染可能性小,操作简便等固有优势,使得前者更适合于柑桔黄龙病的检测。[结论]本研究建立的2种荧光定量PCR方法可以为柑桔黄龙病的病害早期诊断以及柑桔黄龙病病原菌近缘种的甄别提供准确、灵敏、快速的检验检疫技术。

英文摘要:

[Objective] The project aimed to develop an accurate, sensitive and fast technique for the early diagnosis of Huanglongbing and identification of Ca. L. asiaticus. [Method] Conventional and two types of Fluorescence Quantitative Polymerase chain reaction (PCR) including SYBR Green I DNA-binding dye and TaqMan Probe approaches were established and optimized based on two pair of primers, CQULA03F/CQULA03R, CQULA04F/CQULA04R. TaqMan fluorescent probes were designed from the ribosomal protein gene sequence rplJ/rplL of Candidatus Liberibacter asiaticus. The specificity and limitation of both SGI and TaqMan FQ -PCR methods were compared with conventional PCR. This was the PCR for suspension detection of Ca. L. asiaticus collection from citrus leave midrib and recombinant plasmid DNA with a ribosomal protein gene target fragment. We also use the detection systems to monitor the dynamic change of the Huanglongbing pathogen in the host from July of 2004 to May of 2005 and obtained some useful information about the interaction between the host and the pathogen. [Result] The three techniques (Conventional-PCR, SYBR Green I and TaqMan Q-PCR) stably detected target bacteria from symptomatic or asymptomatic citrus samples, and the sensitivity of FQ-PCR is higher than Conventional-PCR at 100-1000-fold (these are 439.0 fg·μl^-1, 4.39 fg·μl^-1, 0.44 fg·μl^-1 for conventional PCR , TaqMan and SGI PCR respectively); the TaqMan Q-PCR has robust specificity and higher accuracy but is more expensive compared with the SGI approach. [Conclusion] This specific, accurate, sensitive and fast technique will play a key role for the early diagnosis of Huanglongbing and identification of Ca. L. asiaticus.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620