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PCA-SVM模型在几丁质酶最适温度建模中的应用
  • ISSN号:1000-5013
  • 期刊名称:《华侨大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q556.2[生物学—生物化学] Q141[生物学—生态学;生物学—普通生物学]
  • 作者机构:[1]华侨大学材料科学与工程学院,福建泉州362021
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(40601046);福建省高等学校新世纪优秀人才计划支持项目(2006),福建省自然科学基金资助项目(B0510011)
中文摘要:

采用主成分分析法(PCA)对样本数据集进行预处理,将得到的新样本数据集输入支持向量机(SVM),籍助均匀设计(UD),构建几丁质酶氨基酸组成和最适温度的数学模型.当径向基核函数的3个参数,惩罚系数C为10,ε为0.5,γ为5时,模型对温度拟合的平均绝对百分比误差为5.06%,预测的平均绝对误差为1.83℃,说明具有良好的预测效果且优于神经网络的预测结果.

英文摘要:

The principal component analysis was applied to the data processing in training sets, the new principal components were then used as input data of support vector machine modle. A prediction model for optimum temperature of chitinase was established based on uniform design. When the regularized constant C, ε and γ were 10, 0.5 and 5, respectively, the calculated temperature fitted the reported optimum temperatUre of chitinase very well and the mean absolute per cent error (MAPEs) was 5.06%. At the same time, the predicted temperature fitted the reported optimum temperature well and the mean absolute error (MAE) was 1.83 ℃. It was superior in fittings and predictions compared to the model based on back propagation neural network.

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期刊信息
  • 《华侨大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:福建省教育厅
  • 主办单位:华侨大学
  • 主编:
  • 地址:中国福建泉州华侨大学校内杨思椿科学馆五楼
  • 邮编:362021
  • 邮箱:journal@hqu.edu.cn
  • 电话:0595-22692545
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5013
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1079/N
  • 邮发代号:34-41
  • 获奖情况:
  • 1995年11月,获教育部科技司颁发的“全国优秀高校...,1997年3月,获中宣部、国家教委、新闻出版署颁发...,1999年7月,获教育部颁发的“全国优秀高校自然科...,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5573