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基于均匀设计的主成分分析-支持向量机模型及其在几丁质酶最适pH建模中的应用
  • ISSN号:1000-3061
  • 期刊名称:《生物工程学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q811.4[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]华侨大学生物工程与技术系,工业生物技术福建省高校重点实验室,泉州362021
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.40601046)、福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划资助基金和福建省自然科学基金(No.B0510011)资助.
中文摘要:

采用主成分分析法对样本数据集进行预处理,将得到的新样本数据集输入支持向量机,籍均匀设计,构建了几丁质酶氨基酸组成和最适pH的数学模型。当惩罚系数C为10,epsilon值为0.7,Gamma值为0.5,模型对pH值拟合的平均绝对百分比误差为3.76%,同时具有良好的预测效果,预测的平均绝对误差为0.42个pH单位。该方法比用BP神经网络方法效果更佳。

英文摘要:

The principal component analysis(PCA) was applied to the data processing in training sets, the new principal components were then used as input data for support vector machine model. A prediction model for optimum pH of chitinase was established based on uniform design. When The regularized constant C, epsilon and Gamma were 10, 0.7 and 0.5 respectively, the calculated pHs fitted the reported optimum pHs of chitinase very well and the MAPEs (Mean Absolute Percent Error) was 3.76%. At the same time, the predicted pHs fitted the reported optimum pHs well and the MAE (Mean Absolute Error) was 0.42 pH unit. It was superior in fittings and predictions compared to the model based on back propagation(BP) neural network.

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期刊信息
  • 《生物工程学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:杨胜利
  • 地址:北京市朝阳区大屯路中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:cjb@im.ac.cn
  • 电话:010-64807509
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3061
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1998/Q
  • 邮发代号:82-13
  • 获奖情况:
  • 北京市优秀科技期刊期刊奖,中国科协首届优秀学术期刊奖,2000年中科院优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18441