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杀虫晶体蛋白Cry1Ac与其配体N-已酰半乳糖胺的对接研究
  • ISSN号:1000-2286
  • 期刊名称:《江西农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.9[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]华侨大学生物工程与技术系,福建泉州362021
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(40601046)、福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划资助项目和福建省自然科学基金项目(B0510011)
中文摘要:

利用同源建模得到杀虫晶体蛋白Cry1Ac的三维结构,之后模拟其与配体N-已酰半乳糖胺的对接,预测关键的氨基酸残基:N482、Q506、S501、L505和V483。Cry1Ac的虚拟突变体与N-已酰半乳糖胺之间的分子对接分析结果表明,R466、R468、R470和R472可能对维持Cry1Ac的DomainⅢ稳定构象起着重要作用。N482和Q506两个残基均含有酰氨基,在对接中易于形成多个氢键,这对稳定对接具有重要作用。研究结果可提供一些有用的信息,用于指导杀虫晶体蛋白的理性设计。

英文摘要:

The 3 -D structure of insecticidal crystal protein Cry1Ac was constructed by homology modeling. The potential docking active cavity was predicted. Molecular docking was simulated between CrylAc and its receptor N -galactosamine. The key residues, N482, Q506, S501, L505 and V483, were predicted. Resuits from the docking simulation between virtual Cry1Ac mutant and N -galactosamine indicated that residues R466, R468, R470 and R472 were important for maintaining a stable conformation of the Domain Ⅲ. N482 and Q506 are liable to form multiple hydrogen bonds, thus are important for a stable docking. The available results in this paper gave helpful imformation for the rational design of insecticidal crystal protein.

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期刊信息
  • 《江西农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江西农业大学
  • 主办单位:江西农业大学
  • 主编:石庆华
  • 地址:江西省南昌市经开区志敏大道1101号江西农业大学期刊社
  • 邮编:330045
  • 邮箱:ndxb7775@sina.com
  • 电话:0791-83813246 83828010
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2286
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1028/S
  • 邮发代号:44-102
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵双百期刊,国家期刊奖百种重点期刊,中国高校精品科技期刊,华东地区优秀期刊,江西省"名刊建设工程"期刊,江西省优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:20807