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中药材威灵仙及其伪品DNA条形码鉴别研究
  • ISSN号:0513-4870
  • 期刊名称:《药学学报》
  • 时间:0
  • 分类:R931[医药卫生—生药学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,北京100193
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(81274013);国家自然科学基金重点项目(81130069);人事部留学人员择优资助项目(2009-2012).
中文摘要:

利用DNA条形码技术对中药威灵仙及其伪品进行鉴别,为威灵仙分子鉴定提供更多依据与参考。本实验利用psbA.trnH序列对来自3个属10个物种的72份威灵仙及其伪品样本进行扩增测序,结合GenBank数据库中7个属21个物种的284条序列,分析ITS、ITS2、psbA.trnH、rbcL、matK各序列种内与种间变异、遗传距离、barcodinggap,并采用最近距离法(nearestdistance)和相似性搜索算法(BLAST1)评价5条序列的鉴定成功率。结果显示psbA.trnH序列在两种DNA序列鉴别评价方法中的效率均较高,且该序列种间变异较大,在barcodin2gap检验中,其序列重叠区较少,种间与种内变异分布呈两边分开的趋势,NJ树分析可将各物种分开,差异显著。综合鉴别效率和扩增成功率,推荐使用psbA—trnH序列作为威灵仙药材及其伪品的鉴别序列。

英文摘要:

This study provides the candidate sequences in the identification of Radix et Rhizoma Clematidis and its adulterants using DNA barcoding. We amplified and sequenced the region psbA-trnH, with the data of 284 sequences from GenBank, the differential intra- and inter-specific divergences, genetic distance, barcoding gap were used to evaluate five barcodes, and the identification efficiency was assessed using BLAST1 and Nearest Distance methods. The results showed that psbA-trnH barcodes performed high identification efficiency and inter-specific divergences among the five different DNA barcodes. Analysis of the barcoding gap and NJ tree showed psbA-trnH was superior to other barcodes. Based on the identification and PCR amplification efficiency, psbA-trnH can be the ideal barcode to identify Radix et Rhizoma Clematidis and its adulterants accurately.

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期刊信息
  • 《药学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国药学会 中国药学科学院药物研究所
  • 主编:王晓良
  • 地址:北京市先农坛街1号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:yxxb@imm.ac.cn
  • 电话:010-63026192
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-4870
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2163/R
  • 邮发代号:2-233
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双高”期刊,2002年为第2届国家期刊奖百种重点科技期刊并获第3...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37721