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田鼠巴贝虫感染FTA-环介导等温扩增检测技术的建立
  • ISSN号:1002-2694
  • 期刊名称:《中国人兽共患病学报》
  • 时间:0
  • 分类:R382[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所,卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室,世界卫生组织疟疾、血吸虫病和丝虫病合作中心,上海200025
  • 相关基金:公益性卫生行业科研专项经费资助项目(No.201202019)和上海市卫生计生委青年基金项目(No.20154Y0155)联合资助
中文摘要:

目的建立敏感、特异、高效的检测田鼠巴贝虫FTA-环介导等温扩增技术(LAMP)。方法根据GenBank公布的田鼠巴贝虫基因序列,就细胞色素B基因保守序列设计了多套LAMP引物,利用LAMP RealTime Turbidimeter LA-320仪筛选最佳引物、反应条件,建立LAMP检测方法,从保存有血液样本的FTA卡片中提取田鼠巴贝虫DNA进行LAMP,观察检测效果。结果设计的4组引物做LAMP试验,其中以引物1,最佳反应温度为64℃,恒温下作用,敏感性高,可在1h内完成,其检出限量为0.687fg/μL,而PCR的最低检测量为0.687pg/μL,与间日疟原虫、恶性疟原虫、卵形疟原虫、三日疟原虫、诺氏疟原虫、冈地弓形虫、利什曼原虫、冈比亚锥虫均无交叉反应。以建立的FTA-LAMP法检测20份PCR检测阳性的田鼠巴贝虫感染者血样,其阳性符合率100%。结论成功建立了检测田鼠巴贝虫特异性细胞色素B基因的FTA-LAMP方法,该法特异性强、灵敏度高、简便、快速、适于现场应用。

英文摘要:

The aim was to establish sensitive,specific and high-performance method of loop-mediated isothermal amplification(LAMP)combined with Flinders Technology Associates(FTA)card for detection of Babesia microti.According to the published sequences of B.microti in GenBank,many pairs of primers were designed targeting the conserved region of Cytochrome B gene of B.microti.The amplification was monitored by LAMP Real Time Turbidimeter LA-320.Through optimizing the LAMP primers and reaction conditions,a rapid and specific detection of B.microti was established.Meanwhile,the amplified products were colored by Calcein that could be detected with naked eyes,and also detected by agarose gel electrophoresis.The method of LAMP showed a highly efficient amplification for B.microti target gene which performed at 64℃for 1h by the LAMP Real Time Turbidimeter LA-320.The detection limit was 0.687fg/μL higher than PCR,no cross reaction with Plasmodium vivax,P.falciparum,P.ovale,P.malariae,P.knowlesi,Toxoplasma gondii,Leishmania donovani,and Trypanosoma gambiense.Blood samples of twenty individuals of positive for B.microti detection with PCR were detected by the established LAMP assay,and the coincidence rate was 100%.FTA-LAMP method for testing the specific cytochrome B gene of Babesia microti is successfully established,with high sensitivity,specificity andsimplicity,and is suitable for field detection.

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期刊信息
  • 《中国人兽共患病学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国微生物学会
  • 主编:严延生
  • 地址:福州市津泰路76号
  • 邮编:350001
  • 邮箱:rsghb@fjcdc.com.cn
  • 电话:0591-87552018
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-2694
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1284/R
  • 邮发代号:34-46
  • 获奖情况:
  • 中国基础医学核心期刊,中国生物医学核心期刊,中国科学引文数据库列为来源期刊及统计源,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9000