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SD大鼠EGF基因cDNA序列的分子克隆
  • ISSN号:1005-4545
  • 期刊名称:中国兽医学报
  • 时间:2013
  • 页码:1399-1402
  • 分类:Q953[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]郑州大学实验动物中心,河南郑州450052, [2]河南中医学院医学机能实验室,河南郑州450046
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31071923)
  • 相关项目:与卷毛和心脏病相关的大鼠动物模型的建立及新突变基因的定位、克隆与功能分析
中文摘要:

参考大鼠EGF基因序列,用PCR方法对SD大鼠EGF基因cDNA序列进行了克隆,获得了SD大鼠EGF基因的3 522bp的cDNA序列(GenBank登录号:JX149564),其中CDS长度为3 186bp,编码了1 061个氨基酸。SD大鼠与国外报道的大鼠、小鼠、原鸡、猕猴、人等5个物种的EGF基因cDNA序列的同源性分别为97.6%、83.4%、59.7%、76.4%、73.5%,其编码蛋白的氨基酸序列同源性分别为99.2%、80.1%、52.6%、69.7%、69.4%。这一结果表明了EGF基因在进化过程中具有一定的保守性,但不同物种之间也具有特异性。通过比较SD大鼠EGF基因与GenBank数据库中发布的EGF基因的cDNA序列,本试验发现了22个SNP位点,其中9个没有改变氨基酸残基的性质,这一研究结果为EGF基因的SNPs数据库提供了新的信息。

英文摘要:

This study was designed to clone and analyze the cDNA encoding EGF from SD rats.The PCR method was developed to clone the EGF cDNA.A full-length cDNA and CDS sequences of SD rat were 3522bp and 3186 bp,which have been accepted by GenBank(Accession Number:JX149564).EGF protein encoded by this gene was composed of 1 061 amino acid residues.The identities of cDNA sequences of EGF gene were 97.6%,83.4%,59.7%,76.4% and 73.5% by homologous comparison among SD rat and other species,and in amino acid sequences were 99.2%,80.1%,52.6%,69.7% and 69.4%,respectively.The result suggested a certain degree of conservation of the EGF gene among different mammalian taxons,but there were some specificity among different mammalian taxons.The results derived from information searching by Blast program revealed there were 22 SNP sites in the sequences of EGF gene cDNA between SD rats and that collected in GenBank.Nine of 22 SNP sites did not alter the related amino acids encoded.The results provided new data for SNPs in EGF gene.

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期刊信息
  • 《中国兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学
  • 主编:王哲
  • 地址:吉林省长春市西安大路5333号
  • 邮编:130062
  • 邮箱:xbcjvs@163.com
  • 电话:0431-87836531 87836534
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4545
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1234/R
  • 邮发代号:12-105
  • 获奖情况:
  • 第二届全国优秀科技期刊评比二等奖,连续多次被评为全军优秀医学期刊一等奖,全国高校优秀自然科学学报评比一等奖,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18973