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RNA二级结构图亏格的动态生成计算法
  • ISSN号:1002-8331
  • 期刊名称:计算机工程与应用
  • 时间:0
  • 页码:26-31
  • 分类:TP301.2[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] Q711[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华侨大学信息管理与信息系统系,福建泉州362021, [2]华侨大学分子药物学研究所,福建泉州362021
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30900822); 华侨大学交叉学科基金(No.JB-JC1004) 华侨大学科研基金资助项目(No.08BS508) 华侨大学侨办科研课题(No.10QZR20)
  • 相关项目:基于信号通路模块的microRNA功能预测与验证
中文摘要:

基于Rivas和Eddy(R&E)RNA二级结构类的图语法,提出了一种计算RNA二级结构图亏格的动态生成算法。与已有的基于判定的亏格计算方法相比,该算法的优点主要有两点:一是提高了计算亏格的效率,二是可以实现枚举小亏格RNA二级结构图。

英文摘要:

A dynamic generation method is presented based on arc graph grammars of Rivas and Eddy(RE)RNA secondary class to calculate the genus of RNA secondary structure graph.Comparing with the determinant method for calculating genus,the presented method mainly has two advantages:the first one is the improvement of the efficiency of genus calculation,the second one is the generation of the mini-genus graphs of RNA secondary structures.

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华北计算技术研究所
  • 主编:怀进鹏
  • 地址:北京市海淀区北四环中路211号北京619信箱26分箱
  • 邮编:100083
  • 邮箱:ceaj@vip.163.com
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-8331
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2127/TP
  • 邮发代号:82-605
  • 获奖情况:
  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:97887