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趋化因子CCR2的同源模建、分子对接和3D-QSAR研究
  • ISSN号:0441-3776
  • 期刊名称:《化学通报》
  • 时间:0
  • 分类:O641.4[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]重庆理工大学药学与生物工程学院,重庆400054, [2]重庆大学化学化工学院,重庆400044
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(81171508); 重庆市自然科学基金重点项目(CSTC 2013 JJB10004); 重庆市教委科技项目(KJ1500943;KJ1400946)资助
中文摘要:

趋化因子CCR2参与炎症反应、免疫移植排斥和肿瘤的发生,已成为新的研究热点。本文以CCR5的晶体结构为模板,同源模建CCR2的结构,并用CCR2小分子抑制剂与其进行分子对接以得到小分子的最优构象。在对接叠合的基础上建立了QSAR模型,采用比较分子场分析(Co MFA)以及比较分子相似性分析(Co MSIA)研究得到Co MFA和Co MSIA模型最佳评价参数分别为q^2=0.743,r^2=0.968和q^2=0.68,r^2=0.978。3D-QSAR模型的等势图分析表明,改造配体R3基团可提高化合物活性。所建模型稳定性好、预测性强,对基于CCR2的小分子抑制剂的设计、优化和改造提供了参考。

英文摘要:

CCR2 plays an important role in aspects of inflammation,transplantation immune rejection and tumor formation. It has become a new biological treatment target. Based on using crystal structure of CCR5 as template,homologous model of CCR2 was built,then docking with small molecule inhibitors to get the optimum configuration of small molecule. The best evaluation parameters of comparative molecular field analysis( Co MFA) and comparative molecular similarity analysis( Co MSIA) models are q^2= 0. 743,r^2= 0. 968 and q^2= 0. 68,r^2= 0. 978,respectively.Through analyzing the potential diagram of 3D-QSAR models,we may safely draw the conclusion that modification on R3 groups can improve the activity of the compound. The established model has a strong ability of prediction. This paper may provide a reference for design,optimization and transformation of small molecule inhibitors CCR2.

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期刊信息
  • 《化学通报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院化学研究所
  • 主编:张德清
  • 地址:北京2709信箱
  • 邮编:100190
  • 邮箱:hxtb@iccas.ac.cn
  • 电话:010-62554183 62588928
  • 国际标准刊号:ISSN:0441-3776
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1804/O6
  • 邮发代号:2-28
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20665