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炔基苯氧乙酸类CRTH2拮抗剂的3D-QSAR研究
  • ISSN号:1000-8861
  • 期刊名称:免疫学杂志
  • 时间:2014.6.1
  • 页码:539-544+549
  • 分类:R329.8[医药卫生—人体解剖和组织胚胎学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]重庆理工大学药学与生物工程学院,400054
  • 相关基金:重庆市自然科学基金重点项目(CSTC2013JJB10004);国家自然科学基金项目(81171508,31170747);重庆市教委科技项目(KJ130809);重庆巴南区科技计划专项(2012Q119)
  • 相关项目:HPV16型E7抗原CTL表位模拟肽抗HPV感染的实验研究
中文摘要:

目的建立CRTH2拮抗剂的3D-QSAR模型。方法采用比较力场分析(CoMFA)法和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)法对103个炔基苯氧乙酸类CRTH2拮抗剂进行三维定量构效关系(3D—QSAR)研究,建立了具有良好预测能力的模型。结果CoMFA法所建模型的交互验证系数q^2为0.763,线性回归系数r^2为0.931,最佳主成分数是6。CoMSIA法采用立体场、静电场、疏水场、氢键供体场所建模型性能最佳,其中q^2和r^2分别为0.644、0.904;最佳主成分数是6。结论3D—QSAR模型及力场贡献值分析揭示了分子结构和结合常数间的关系,为今后的炔基苯氧乙酸类化合物的设计改造提供了更盲捧可行的线索。

英文摘要:

CRTH2 receptor plays an important role in the nosogenesis of inflammatory diseases. In this study, the 3D-QSAR of 103 alkynyl acetic acid antagonists was analyzed by CoMFA and CoMSIA methods to establish a good predictive model. The best 3D-QSAR model was obtained with cross-validated correlation coefficient q^2 values, the calibrated correlation coefficient (r^2) and principal-component (n) of 0.763, 0.931 and 6 for CoMFA, respectively. The best results of CoMSIA model was built by steric, electrostatic, hydrophobic, hydrogen bond aeceptor field. The q^2 values, r^ and n of CoMSIA are 0.644, 0.904 and 6. The result reveals the relationship between molecular structure and binding constant, and would benefits the future rational design of potent antagonists.

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期刊信息
  • 《免疫学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:第三军医大学
  • 主办单位:第三军医大学 中国免疫学会
  • 主编:吴玉章
  • 地址:重庆市沙坪坝高滩岩
  • 邮编:400038
  • 邮箱:richard@mail.tmmu.com.cn
  • 电话:023-68752237
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8861
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1332/R
  • 邮发代号:78-32
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊三等奖,全军优秀医学期刊奖,重庆市优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13273