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氰基吡咯烷类FAP 抑制剂的分子对接及3D-QSAR 研究
  • ISSN号:1004-1656
  • 期刊名称:《化学研究与应用》
  • 时间:0
  • 分类:O626.2[理学—有机化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]重庆理工大学药学与生物工程学院,重庆400054, [2]重庆大学化学化工学院,重庆400044
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(81171508)资助;重庆市自然科学基金重点项目(CSTC 2013 JJB10004)资助;重庆市教委科技项目(KJ1500943,KJ1400946)资助
中文摘要:

成纤维细胞激活蛋白(FAP)与肿瘤微血管的形成和肿瘤的生长密切相关,是药物设计的理想靶点。本文运用分子对接分析51 个(4-喹啉)-甘氨酰-氰基吡咯烷衍生物与FAP 受体的相互作用,研究结果表明吡咯烷衍生物与FAP 受体ASP46、THR51、GLN721 等氨基酸残基形成氢键和立体作用。采用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)组合场进行3D-QSAR 研究。CoMFA 和CoMSIA 模型的q2 及r2 分别为0. 821,0. 967 和0. 710,0. 951,3D-QSAR 结果表明模型具有较强的预测能力。3D-QSAR 等势图显示小分子的立体、静电、疏水、氢键等性质影响生物活性,与分子对接结果一致,为设计出更高活性吡咯烷类抑制剂提供借鉴。

英文摘要:

FAP involved in the formation of tumor microvascular and tumor growth was an ideal target for drug design. In this paper,the interaction of 51(4-Quinolinoyl)glycyl-2-cyanopyrrolidine scaffold derivatives and the FAP receptor based on the Surflex-dockwas studied. The result showed that pyrrolidine derivatives combine with FAP receptor amino acid residues ASP46,THR51,GLN721with hydrrgen bond and steric interactien. Then the combined field of CoMFA and CoMSIA was used to analyze 3D-QSAR models.The model(CoMFA with q2 = 0. 821,r2 = 0. 967,n = 5;CoMSIA with q2 = 0. 710,r2 = 0. 951,n = 4)had a good predictability. 3DQSARcontour maps indicated the steric,electrostatic,hydrophobic and hydrogen bond fields had a crucial effects to derivatives biologicalactivity,which in common with Surflex-Dock result. These datum provided significant theoretical foundation for designingpyrrolidine scaffold derivatives inhibitors.

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期刊信息
  • 《化学研究与应用》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:四川省科学技术协会
  • 主办单位:四川省化学化工学会 四川大学
  • 主编:胡常伟
  • 地址:成都市武候区望江路29号四川大学化学学院内
  • 邮编:610064
  • 邮箱:chemra@scu.edu.cn
  • 电话:028-85418495
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-1656
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1378/O6
  • 邮发代号:62-180
  • 获奖情况:
  • 化学类中文核心期刊,美国化学文摘(CA)收录期刊,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16918