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丙型肝炎病毒NS5A抑制剂的3D—QSAR研究
  • ISSN号:1674-8425
  • 期刊名称:《重庆理工大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:R914.2[医药卫生—药物化学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]重庆理工大学药学与生物工程学院,重庆400054, [2]重庆大学化学化工学院,重庆400044
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(81171508);重庆市自然科学基金重点项目(CSTC2013JJB10004);重庆理工大学研究生创新基金资助项目(YCX2013222)
中文摘要:

摘要:丙型病毒性肝炎感染是输血后肝炎的主要病因之一。NS5A蛋白的小分子抑制剂显示出很强的体外抑制病毒生长的活性,并且初步的临床评价也证实了NS5A抑制剂能很好地抑制体内丙型肝炎病毒的生长。因此,研发高效的Ns5A小分子抑制剂为治疗丙型肝炎提供了新的策略。进行了daclatasvir丙型肝炎病毒NS5A复制抑制剂的三维定量构效关系(3D.QSAR)研究,通过SYBYL—X2.1.1分子模拟软件系统搜寻方法搜寻出化合物的最低能量构象,然后在Triops力场中用共轭梯度最小化进行优化。应用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)进行分子活性构象的选择、分子叠合、建立空间场范围以及数据统计。用22个衍生物作为训练集建立模型,用6个衍生物作为测试集来验证模型的优劣。结果表明:CoMFA模的交叉相互验证系数q。=0.578,回归系数r。=0.939,CoMSIA模型的q2=0.584,r2=0.968。这些结论为丙型肝炎病毒NS5A复合体抑制剂的药物设计和筛选提供了理论依据。

英文摘要:

Viral hepatitis C infection is one of the main causes of the hepatitis after blood transfusion. NSSA protein of small molecule inhibitors shows strong activity in inhibiting the growth of the vitro vi- rus, and the preliminary clinical evaluation also confirmed that NSSA inhibitors can inhibit the growth of hepatitis c virus in the body. Therefore, the research and development of efficient NSSA small mol- ecule inhibitors provides a new strategy for the treatment of hepatitis C. In this study, we investigated the daclatasvir hepatitis C virus NS5A inhibitor complex 3D-QSAR, and searched out the lowest ener- gy conformations of compounds through SYBLE-X 2.1.1 molecular modeling software system search method, and then Triops force field conjugate gradient minimization optimization. Comparative Molec- ular Field Analysis (CoMFA) and Comparative Molecular Similarity Indices Analysis (CoMSIA) were used to have molecular active conformation selection, molecular alignment, as well as the establish- ment of spatial statistics field range. In this experiment, taking 22 derivatives as the training set to build the model, the merits of the model was validated with 6 derivatives as a test set. Results show that Cross CoMFA model' s mutual authentication factor q2 = 0. 578, and the regression coefficient r2 = 0. 939, while CoMSIA model q2 = 0. 584, theoretical basis for drug design and screening and the r2 = 0. 968. These conclusions laid a reliable of hepatitis C virus NS5A complex inhibitors.

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期刊信息
  • 《重庆理工大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:重庆市教育委员会
  • 主办单位:重庆理工大学
  • 主编:李志雄
  • 地址:重庆市巴南区红光大道69号
  • 邮编:400054
  • 邮箱:xb@cqut.edu.cn
  • 电话:023-68667255
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-8425
  • 国内统一刊号:ISSN:50-1205/T
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 连续3次获:重庆市一级期刊“称号,2011年入选”RCCSE中国核心学术期刊“
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊
  • 被引量:3795