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中国儿童急性淋巴细胞性白血病染色体6q16.3~21区域候选肿瘤抑制基因的定位与鉴定
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:生物化学与生物物理进展
  • 时间:0
  • 页码:65-71
  • 语言:中文
  • 分类:R725.5[医药卫生—儿科;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]中南大学湘雅医院儿科,长沙410008, [2]湖南师范大学生命科学院,长沙410081
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30571982,30270722).
  • 相关项目:中国儿童急性淋巴细胞性白血病6q16.3-6q21候选肿瘤抑制基因的分离及功能研究
中文摘要:

为了克隆儿童急性淋巴细胞性白血病(ALL)候选肿瘤抑制基因,首先选取分布于6q16.3~21上的11个多态性微卫星标记,对139例中国儿童ALL标本进行杂合性缺失(LOH)分析.分析显示32%的患者存在至少一个位点的LOH,且高频缺失区位于D6S1709~D6S301之间,大小为2cM.各位点LOH与白细胞总数、病态细胞数有显著性相关(P〈0.05),与年龄、性别、形态学分型和免疫学分型无显著相关(P〉0.05).进一步在高频缺失区域内,采用定位候选克隆策略、生物信息学技术及RT—PCR技术筛选、鉴定与儿童ALL相关的候选肿瘤抑制基因及其cDNA片段.在D6S1709~D6S301之间筛选到一个在儿童ALL细胞中低表达的EST(GenBank登录号:AA403058),与正常外周血单个核细胞比较,在15例ALL患者中有10例表达下调(P〈0.05).采用数字化差异表达分析显示,位于6q16.3~21区域内的AMD1基因、PPIL6基因和WASF1基因在肿瘤组织中的表达丰度要低于正常组织(P〈0.05).上述结果为进一步在6q16.3~21区域克隆肿瘤抑制基因提供了线索.

英文摘要:

In order to identify candidate tumor suppressor genes (TSGs) in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), firstly, loss of heterozygosity (LOH) of 6q16.3 - 21 in 139 primary ALL samples was analyzed by using polymerase chain reaction (PCR) and 11 microsatellite markers. The frequency of LOH on 6q16.3-21 was 32%. A 2-cM high frequency deletion region was flanked by D6S1709 and D6S301 loci at 6q16.3-21. Clinical data showed that patient with 6q16.3-21 LOH had higher WBC counts and blast cells (P 〈 0.05). The statistics about age, sex, classification of morphology and immunology were indistinct (P 〉 0.05). Then, positional cloning strategy, bioinformatics technology and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) were used to identify candidate TSGs and its eDNA fragments at 6q16.3-21, especially at the high frequency deletion region. Comparing with expression of normal peripheral blood mononuclear cell, EST screened in D6S1709-D6S301 (GenBank Accession No.AA403058) was down-regulation in ten of fifteen childhood ALL (P 〈 0.05). Digital differential display showed that the expression levels of AMD1, PPIL6 and WASF1 were lower in cancer tissues than in normal tissues(P 〈 0.05). These findings may provide new clues in cloning of childhood ALL TSGs at 6q16.3-21.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821