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大豆苹果酸脱氢酶基因的电子克隆与生物信息学分析
  • ISSN号:1000-7091
  • 期刊名称:华北农学报
  • 时间:2012.6.6
  • 页码:23-28
  • 分类:S565.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]河北农业大学教育部"华北作物种质资源研究与利用"重点实验室,河北保定071001, [2]河北农业大学,河北保定071001
  • 相关基金:国家转基因重大专项资助项目(2009ZX08004-004B); 国家自然科学基金项目(31071441); 河北省自然科学基金项目(C2010000749); 河北省教育厅科学研究项目(2009)
  • 相关项目:大豆磷营养高效转录因子及磷酸酶基因克隆与功能分析
中文摘要:

利用电子克隆技术获得大豆中的苹果酸脱氢酶基因cDNA序列,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析和预测,为进一步克隆该基因、解决植物磷高效基因数量缺乏等问题提供依据。结果表明,大豆中的苹果酸脱氢酶基因(GmMDH1)cDNA序列长度为1 574 bp,开放阅读框1 230 bp,编码409个氨基酸残基;编码蛋白含有NAD bindingsite,Dimerization interface,Substrate binding site,MDH_glyoxysomal_mitochondrial结合位点和保守域,属于LDH_MDH_like Superfamily家族;亚细胞定位分析显示,编码蛋白位于植物细胞的叶绿体中。

英文摘要:

To obtain more plant high phosphorus-efficiency related genes,one plant high P-efficiency gene,named malate dehydrogenase gene(MDH),was isolated from soybean by using the in silico cloning technique.And the protein of this gene was also predicted and studied through the bioinformatics analysis method.The results showed that the cDNA length of soybean malate dehydrogenase gene GmMDH1 was 1574 bp,which included a 1230 bp open reading frame (ORF) and encoded 409 amino acids residue.The encoding protein of GmMDH1 possessed NAD binding site,dimerization interface,substrate binding site,MDH_glyoxysomal_mitochondrial,LDH_MDH_like super-family domains and was predicted to locate in cell chloroplast.

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期刊信息
  • 《华北农学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河北省农林科学院
  • 主办单位:山西省农业科学院 山西省农学会 河南省农业科学院 河南省农学会 天津市农业科学院 天津市农学会等
  • 主编:王海波
  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 邮编:050051
  • 邮箱:hbnxb@163.com
  • 电话:0311-87652166
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7091
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1101/S
  • 邮发代号:18-10
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国综合性农业核心期刊,中国科学引文数据库核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32962