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蚯蚓金属硫蛋白定量PCR检测方法及其分子诊断
  • ISSN号:1000-6923
  • 期刊名称:中国环境科学
  • 时间:2011
  • 页码:1377-1382
  • 分类:X17[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]南开大学环境科学与工程学院,环境污染过程与基准教育部重点实验室,天津市城市生态环境修复与污染防治重点实验室,天津300071, [2]农业部环境保护科研监测所,天津300191
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(21037002); 国家环保公益性项目(201009032)
  • 相关项目:土壤污染微界面过程及其分子诊断与调控原理
作者: 陈春|周启星|
中文摘要:

根据GenBank中蚯蚓(Eisenia fetida)金属硫蛋白(MT)基因序列设计合成引物,采用RT-PCR扩增出目的基因片段,将目的基因片段插入pEASY-Blunt中制备质粒标准品.通过不同梯度稀释倍数的质粒标准品,建立了目的基因MT与内参基因β-actin的SYBR Green I荧光定量RT-PCR检测方法.通过土壤染毒培养实验,将蚯蚓分别暴露于50,500,1000mg/kg重金属Cd染毒的自然土壤中培养14,28d,研究蚯蚓体内MT mRNA转录水平的表达变化.结果表明,重组质粒测序后显示目的片段序列同源性好,证明所设计的MT、β-actin引物能成功用于蚯蚓MT mRNA的检测.两基因构建的荧光定量标准曲线线性关系分别为0.994,0.999,且PCR扩增效率也皆接近于100%.染毒实验发现,Cd可诱导蚯蚓体内MT mRNA的表达,其表达水平与Cd污染暴露呈现出剂量-效应和时间-效应关系,表明蚯蚓MT基因可作为潜在分子标志物,诊断环境中Cd污染及其暴露水平.

英文摘要:

The primers were designed based on previous reported sequence of metallothionein(MT) gene.Selected genes were amplified by RT-PCR and cloned into pEASY-Blunt vector to construct recombinant plasmid.Standard curves of target gene(MT) or reference gene(β-actin) were generated using serial dilution of recombinant plasmids cDNA.And the method of SYBR Green I real-time quantitative PCR was established for the detection of MT mRNA transcript level.Moreover,MT gene expression level was detected in Eisenia fetida after 14 and 28d of exposure to 50,500,1000mg/kg Cd.The results of sequence alignment showed that the sequences of cDNA fragments in recombinant plasmid were confirmed to be correct corresponding to previous known genes,which indicated that MT and β-actin cDNA fragments were cloned respectively.The liner correlation coefficient of two standard curves was 0.994 and 0.999,respectively and PCR amplification efficiencies were both close to 100%.Therefore,the real-time PCR detection of MT gene expression was sensitive,specific and reliable.Furthermore,the expression level of MT gene was significantly(P0.01) up-regulated in a dose-dependent and time-dependent manner.The highest(36.8-fold) up-regulation level was found in E.fetida after 28d of exposed to 1000mg/kg Cd compared to controls.These results suggested that MT may be applied as a molecular biomarker provide early warning signs for the stress of Cd exposue in future.

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期刊信息
  • 《中国环境科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国环境科学学会
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  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6923
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2201/X
  • 邮发代号:2-572
  • 获奖情况:
  • 国家期刊提名奖,国家“双效”期刊,第三届中国科协优秀科技期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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