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氯化钠促进溶菌酶聚集机制的分子动力学研究
  • ISSN号:1000-1832
  • 期刊名称:《东北师大学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q71[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]辽宁大学生命科学学院,辽宁沈阳110036
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30970152); 辽宁省教育厅优秀人才基金资助项目(2009R26)
中文摘要:

氯化钠能够在一定的条件下促进溶菌酶发生聚集,但其具体的作用机制目前还尚不明确.采用分子动力学模拟的方法研究了鸡溶菌酶单体在含500mmol/L NaCl和不含NaCl两种体系中的结构变化.模拟的结果表明:NaCl能够使溶菌酶聚集关键区域(40~110位残基)内二硫键cys76-cys94的结合强度减弱,同时破坏了该区域内的氢键网络,从而导致了蛋白结构的不稳定性;另一方面,NaCl也促使疏水核心发生了一定的扩张,使疏水核心内氨基酸残基的结合变得更加松散,从而促进了溶菌酶分子间的相互作用.

英文摘要:

Sodium chloride(NaCl) could induce lysozyme aggregation under some conditions,but the detail mechanism has been poorly understood.In this study,performed 10 ns molecular dynamic simulations to investigate the structure changes of chicken lysozyme monomer when treated with 500 mmol/L NaCl.The simulation results indicated that NaCl could weaken the disulfide bond cys76-cys94 as well as the hydrogen bonding network in the aggregation critical region,which might lead instability of the lysozyme structure.In addition,results also showed that the hydrophobic core had an apparent expanding tendency when treated with NaCl,which might promote the intermolecular interactions between lysozyme monomers.

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期刊信息
  • 《东北师大学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:东北师范大学
  • 主编:刘宝
  • 地址:长春市净月大街2555号
  • 邮编:130117
  • 邮箱:dslkxb@nenu.edu.cn
  • 电话:0431-89165992
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1832
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1123/N
  • 邮发代号:12-43
  • 获奖情况:
  • 中文综合性科学技术类核心期刊,中国科学引文数据库来源期刊,中国科技论文统计源期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:7830