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Hsc70-Auxilin复合物的拉伸分子动力学模拟
  • ISSN号:1000-1700
  • 期刊名称:《沈阳农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q71[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]辽宁大学环境学院,辽宁沈阳110036, [2]辽宁大学生命科学院,辽宁沈阳110036, [3]辽宁大学轻型产业学院,辽宁沈阳110036
  • 相关基金:国家自然科学基金(30970152); 辽宁省教育厅优秀人才项目(2009R26)资助
中文摘要:

Hsc70与auxilin蛋白组成的系统是Hsp70/Hsp40分子伴侣系统家族的一员,在热休克反应中发挥重要作用。本文为得出auxilin蛋白J结构域的关键氨基酸,首先采用由二硫键交联的Hsc70 R171C与auxilin D876C的复合物结晶结构作为初始模型,进行分子动力学模拟,通过比较平衡后的结合部位发现,将形成二硫键的氨基酸突变为原来的氨基酸结构在结合位点上与生化结果较为相近,之后利用此结构通过拉伸动力学模拟分析了auxilin蛋白J结构域与Hsc70的ATPase功能域的解离过程,并探讨了Hsc70与auxilin蛋白之间的相互作用力。结果表明位于HPD loop上的His874,Asp876,Thr879,螺旋Ⅲ上的Glu884,Asn895,Asp896,Ser899,Glu902,Asn903为关键氨基酸,这些数据符合之前核磁共振实验证实的T抗原J结构域的HPD基序和螺旋Ⅲ与Hsc70的ATPase功能域之间的相互作用。

英文摘要:

The Hsc70 and auxilin complex belongs to the Hsp70 and Hsp40 family, a chaperone system bestknown for its role in the heat shock response. The model of the Hsc70/auxilin complex molecule used in our studyhad the crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine Hsc70 R171C and bovine auxilinD876C. In order to confirm the important residues, we first analyzed the stable model after the moleculardynamics simulation(MD). The binding site of the mutated(original) model was more aligned with previousbiochemical results. After that, steered molecular dynamics simulations(SMD) were applied to this stable modelto investigate the dissociation of the bovine auxilin J-domain and the Hsc70 ATPase domain, and theHsc70-auxilin interactions were also investigated. Our data indicated that His874, Asp876, and Thr879 from theHPD loop, Glu884, Asn895, Asp896, Ser899, Glu902 and Asn903 from helix Ⅲ are important residues.These data agreed with a previous NMR evidence that helix Ⅲ and HPD motif of large T antigen J-domaininteracted with Hsc70 ATPase domain.

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期刊信息
  • 《沈阳农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:沈阳农业大学
  • 主编:李天来
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  • 邮编:110161
  • 邮箱:syndxb@126.com
  • 电话:024-88487082 88487083
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1700
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1134/S
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  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
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