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西藏僜人mtDNA高变Ⅰ和高变Ⅱ区序列多态性分析
  • ISSN号:1003-9406
  • 期刊名称:《中华医学遗传学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R392.11[医药卫生—免疫学;医药卫生—基础医学] R373.21[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]西藏民族学院生命科学基础实验室,高原环境与疾病相关基因研究实验室,陕西咸阳市712082, [2]西藏职业技术学院, [3]西藏大学医学院
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30760097);教育部重点课题(208138);中国博士后基金(200902208)
中文摘要:

目的探讨生活在西藏林芝地区僜人群体线粒体DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)控制区的两个高变区(hypervariableregions,HVR)Ⅰ、Ⅱ的多态性。方法采用PCR扩增和末端标记荧光循环测序的方法,对119名僜人无关个体进行了序列分析。结果共观察到110个变异位点,序列变异包括了碱基的转换、颠换、插入、缺失等各种类型。其中,在HVRI区(nt16024-nt16365)内观察到68个变异位点,119种单体型,基因多样性(h)为0.9916;在HVRⅡ区(nt73-nt340)内观察到42变异位点,113种单体型,基因多样性为0.9907;随机匹配概率(randomlymatchingprobability,RMP)在HVRⅠ和HVRⅡ区的P值分别为0.0084和0.0093;联合两个高变区序列,可观察到119种不同的单体型,随机匹配概率P值为0.0084。结论西藏僜人与其他群体比较有其独特的线粒体DNA序列遗传特点,与中国汉族及亚洲其他群体有明显差异。线粒体DNA序列多态性在群体遗传学调查及法医学个体识别方面有广泛的应用前景。

英文摘要:

Objective To analyze the sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA hypervariable regions Ⅰ (HVR Ⅰ ) and HVR Ⅱ in the Deng population in Linzhi area of Tibet. Methods rntDNAs obtained from 119 unrelated individuals were amplified and directly sequenced. Results One hundred and ten variable sites were identified, including nucleotide transitions, transversions, and insertions. In the HVR Ⅰ region (nt16024-nt16365), 68 polymorphic sites and 119 haplotypes were observed, the genetic diversity was 0. 9916. In the HVRⅡ (nt73-nt340) region, 42 polymorphic sites and 113 haplotypes were observed, and the genetic diversity was 0. 9907. The random match probability of the HVRⅠ and HVRⅡ regions were 0. 0084 and 0. 0093, respectively. When combining the HVRI and HVRⅡ regions, 119 different haplotypes were found. The combined match probability of two unrelated persons having the same sequence was 0. 0084. Conclusion There are some unique polymorphic loci in the Deng population. There are different genetic structures between Chinese and other Asian populations in the mitoehondrial DNA D-loop region. Sequence polymorphism of mitochondrial DNA HVR Ⅰ and HVR Ⅱ can be used as a genetic marker for forensic individual identification and genetic analysis.

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期刊信息
  • 《中华医学遗传学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:成都市人民南路3段17号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:cjmg@cma.org.cn
  • 电话:028-85501165
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-9406
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1374/R
  • 邮发代号:62-163
  • 获奖情况:
  • 2000年获四川省优秀期刊一等奖,1997年获中国科协优秀期刊二等奖,2000年获中华医学优秀期刊银奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12609