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G-四链体与配体相互作用的研究方法进展
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:生物化学与生物物理进展
  • 时间:2015.7
  • 页码:624-638
  • 分类:O657[理学—分析化学;理学—化学] Q52[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]北京理工大学生命学院,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金(21175011,21375008); 国家重点基础研究发展计划(973)(2012CB910603)资助项目
  • 相关项目:蛋白质核酸适配体高效筛选的毛细管电泳方法学基础研究
中文摘要:

核酸的G-四链体结构在原核生物和真核生物的基因组中广泛存在,并参与基因复制和重组、端粒延伸、基因表达调控等多种重要的生物学过程.G-四链体与配体如Telomestatin、TMPy P4、BRACO-19、RHPS4等的相互作用研究有助于阐明其生物学功能.G-四链体与配体分子间的相互作用研究应用多种分析方法,如硫酸二甲酯印迹、凝胶迁移、聚合酶终止实验等生物化学法,而现代分析技术包含圆二色谱、荧光光谱、荧光共振能量转移、核磁共振、X-射线晶体衍射等光谱法,以及表面等离子体共振、电喷雾质谱和毛细管电泳法等.本文综述了可与G-四链体结合的配体以及G-四链体与配体相互作用的研究方法,并对各种方法进行了比较.

英文摘要:

G-quadruplex structures of nucleic acids have been demonstrated to be widely existed in the genomes of prokaryotes and eukaryotes,meanwhile,involved in many biological processes,such as gene replication and recombination,telomere elongation,regulation of genetic expression,etc.Studying the interactions between G-quadruplex and ligands,such as Telomestatin,TMPy P4,BRACO-19,RHPS4,contributes to understand the roles of G-quadruplex and the corresponding mechanisms in biological processes.The research relies on a variety of analytical methods.Biochemical methods includes DMS footprinting,EMSA and DNA polymerase stop assay,and spectroscopy methods,such as circular dichroism,fluorescence spectrum,fluorescence resonance energy transfer,nuclear magnetic resonance and X-ray crystal diffraction.In addition,surface plasma resonance,electrospray ionization mass spectrometry and capillary electrophoresis are also included.This paper reviews the ligands targeting G-quadruplex and methods mentioned above for characterizing G-quadruplex's structures and interactions with ligands.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821